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笔冰河

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质二级结构预测

请问预测蛋白质二级结构一般用什么软件呢,哪位好心人能发我一个呢,灰常感谢哈!
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宇宙心灵

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励积极应助哦 2012-02-20 13:38:40
笔冰河(金币+2): ★★★很有帮助 多谢了 2012-02-20 13:57:50
蛋白质二级结构预测软件有很多,各有优缺点,本人较喜欢使用一款在线的工具,是蛋白序列二级结构预测综合站点,从该网站出发,输入蛋白序列,可以根据需要,使用各种在线预测工具,包括Coils、nnPredict、PSSP/SSP、PSSP/NNSSP、SAPS、TMpred、SOUSI、Paircoil、Protein Hydrophilicity/Hydrophobicity Search、SOPM,使用十分方便。

连接地址:http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/
进去后选择"Choose a type of search from the pull-down menu”
希望对你有所帮助!祝好!
赢在交流!
2楼2012-02-20 11:19:58
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lvtd

金虫 (小有名气)

内容已删除
tobeornottobe,thisisaquestion!
3楼2012-02-20 11:20:54
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笔冰河

银虫 (小有名气)

内容已删除
4楼2012-02-20 14:00:13
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笔冰河

银虫 (小有名气)

请问下用什么软件可以确定蛋白质的一级结构,即蛋白质的N、C端,重复单元的区域分布
5楼2012-02-20 15:01:11
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笑看人生417

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
笔冰河(金币+1): 有帮助 2012-02-22 12:43:01
1.DNAMAN,DNASTAR
2.NCBI网站
3.最推荐的一个就是bioedit 功能不是一般的强大
6楼2012-02-20 15:41:25
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笑看人生417

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

笔冰河(金币+1): 有帮助 2012-02-22 12:43:48
引用回帖:
5楼: Originally posted by 笔冰河 at 2012-02-20 15:01:11:
请问下用什么软件可以确定蛋白质的一级结构,即蛋白质的N、C端,重复单元的区域分布

直接分析出三级蛋白结构就行了,会出现N--C的延伸。很清楚明了,一级结构貌似就是指碱基序列,看不出N,C端吧
7楼2012-02-20 15:44:05
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
笔冰河(金币+1): 有帮助 2012-02-22 12:43:19
http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
选择Predict Secondary Structure (PSIPRED v3.0)
8楼2012-02-20 16:50:21
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希罗雅

银虫 (小有名气)

凡事学习
9楼2012-02-21 17:06:29
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leoselphin

木虫 (小有名气)

Protein Hydrophilicity  吧???
10楼2012-02-26 09:27:38
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