应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 千兆网vasp跨节点并行慢的很，正常吗？
131/1返回列表
查看: 2256  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lzllzl

木虫 (小有名气)

[交流] 千兆网vasp跨节点并行慢的很，正常吗？

请教大家：

  我们最近建立了cluster（Intel Xeon 5650 6核*2 / 48GB内存），编译：Openmpi+intel+mkl，
通讯是千兆网，vasp跨节点并行慢的很，两个节点比一个节点慢几倍，远远不如一个节点并行的计算
速度。是不是说千兆网vasp就不能很有效地跨节点并行呢？

非常感谢大家的讨论！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-02-18 10:59:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sandycug

金虫 (小有名气)
★
lzllzl(金币+2):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢分享经验~~ 2012-02-18 14:37:05
这个是很正常的
事实上，网络延迟已经成了阻碍HPC发展的一个瓶颈
5650的CPU的计算速度所需要的数据交换远非千兆网所能满足的了
至少应该上20GB的Infiniband网络
当然，万兆网也可以考虑
赞一下 回复此楼
2楼2012-02-18 13:43:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sandycug

金虫 (小有名气)
★
lzllzl(金币+2):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢交流 2012-02-18 14:37:35
VASP是一个并行效率很好的程序
如果网络允许的话
5650的CPU同时使用16个以下应该都有非常好的加速比
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-18 13:46:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hls85915

荣誉版主 (文坛精英)
★
lzllzl(金币+2):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-18 14:37:49
很正常的，楼主不用担心
赞一下 回复此楼
7楼2012-02-18 13:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzllzl

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by sandycug at 2012-02-18 13:43:15:
这个是很正常的
事实上，网络延迟已经成了阻碍HPC发展的一个瓶颈
5650的CPU的计算速度所需要的数据交换远非千兆网所能满足的了
至少应该上20GB的Infiniband网络
当然，万兆网也可以考虑

但是同样编译的abinit和pwscf能并到5个节点，速度还不错。这能不能说是
vasp编译的问题呢？
赞一下 回复此楼
9楼2012-02-18 15:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzllzl

木虫 (小有名气)
但是同样编译的abinit和pwscf都能并到5个节点，能不能说是
vasp编译的问题呢？
赞一下 回复此楼
10楼2012-02-18 15:09:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wyxhenu

新虫 (小有名气)
★
lzllzl(金币+2):谢谢参与
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-18 16:43:12
没什么问题  VASP是带并行  abinit是k点并行
赞一下 回复此楼
11楼2012-02-18 16:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)
★
lzllzl(金币+2):谢谢参与
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2012-02-18 21:15:19
我的也是，千兆级别的更本不行，害得我现在是单机跑的。。。
赞一下 回复此楼
12楼2012-02-18 17:59:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sandycug

金虫 (小有名气)
呵呵，事实上abinit跟pwscf的并行效率都不算很好
特别是pwscf
只不过它们对网络的要求没有那么高而已
赞一下 回复此楼
13楼2012-02-19 14:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
kanghuijun4楼
2012-02-18 13:53   回复  
lzllzl(金币+2):谢谢参与
kanghuijun5楼
2012-02-18 13:53   回复  
lzllzl(金币+2):谢谢参与
zhaojunlong3276楼
2012-02-18 13:54   回复  
lzllzl(金币+2):谢谢参与
linjinbin108楼
2012-02-18 14:13   回复  
lzllzl(金币+2):谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 lzllzl 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 8/400 2026-03-17 19:03 by Wangjingyue
[考研] 274求调剂0856材料化工 +13 z2839474511 2026-03-11 14/700 2026-03-17 16:51 by share_joy
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +4 梨花珞晚风 2026-03-17 4/200 2026-03-17 13:38 by houyaoxu
[考博] 26申博 +4 八旬速览 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 331求调剂（0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭