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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 表面分子吸附的几何优化
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Tea_Candy

金虫 (小有名气)

[求助] 表面分子吸附的几何优化

我想重复一下文献中的实例，计算一分子吸附在一表面后对其电子结构的影响。
首先是建立模型，优化结构。
我按照文献中的模型建立好了，双原子分子垂直于吸附表面，但是优化完之后吸附距离和吸附位置与文献中都不同。
参考了http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2512497和http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2458566&page=1两个帖子，屡次修改参数仍未得到满意的结果，只有吸附距离发生改变（但与文献值仍然差0.4埃左右），吸附位置根本未变。。求各位虫友指教。。
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Life is more than Chemistry.
1楼 2012-02-16 16:48:38
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CKX

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
fzx2008(金币+1): 谢谢回帖交流！ 2012-02-17 08:42:38
人家的未必是正确的；或者人家的和你的不是同一个能量极小点。关键看吸附能
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2楼2012-02-17 08:40:10
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hakuna

木虫 (知名作家)
WDD880227(金币+1): 感谢交流 2012-02-21 08:27:58
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-02-21 09:14:49
0.4埃的差别是有点大了，检查一下你初始结构的合理性以及你所使用的参数是否同文献一致，不同软件结果会有差异，但不应该这么大（泛函、赝势相同的情况下）
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3楼2012-02-21 07:10:41
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Tea_Candy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by CKX at 2012-02-17 08:40:10:
人家的未必是正确的；或者人家的和你的不是同一个能量极小点。关键看吸附能

谢谢解答，吸附能是差不多的，都是优化的全局能量最小值。主要问题是我自己优化时，吸附位点A、B的能量明显有差异时，优化结果也没有将构型移到能量最低点对应的构型，感觉就是整个优化中，原子的移动很微小，不会有较大的变动。
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Life is more than Chemistry.
4楼2012-02-24 01:07:00
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Tea_Candy

金虫 (小有名气)
★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。。。。。 2012-03-19 12:55:59
引用回帖:
楼: Originally posted by hakuna at 2012-02-21 07:10:41:
0.4埃的差别是有点大了，检查一下你初始结构的合理性以及你所使用的参数是否同文献一致，不同软件结果会有差异，但不应该这么大（泛函、赝势相同的情况下）

谢谢交流，文献用的是SIESTA，我用的vasp，泛函赝势（GGA，pw91）都一样，最近算得吸附能、内聚能的值都差不多，就是吸附距离差异大，而且我静态计算了一系列的间距所对应的能量，发现能量最低点的距离比文献大了1埃左右，
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Life is more than Chemistry.
5楼2012-02-24 01:11:13
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hwying

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2012-03-19 12:55:17
Tea_Candy: 金币+5, ★有帮助, 谢谢您的回答 虽然我还在纠结 2012-04-09 16:32:33
这个要看你的层数、真空层，放开层数，动能截断值等等参数是否一致，这样才有可比性。
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重新开始
6楼2012-03-19 11:36:10
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