应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】ATK优化计算不收敛怎么办
161/2返回列表12下一页
查看: 1947  |  回复: 15
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lywhit

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】ATK优化计算不收敛怎么办已有8人参与

SimulationType::Type                              Relaxation
Relaxation::Type                                  CG
Relaxation::MaxSteps                              200                 
Relaxation::ForceTolerance                        0.05000 eV/Ang      
Relaxation::MaxDisplacement                       0.05292 Ang         



计算了2天之后出现如下错误，
ERROR: Failed to relax the system using CG algorithm.

不知该如何解决？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

transport

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2010-04-29 15:10:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3):感谢指导 2010-05-20 18:13:43
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-07 16:55:39:

你所谓的加上电极之后在优化，这个阶段电极固定吗？还是电极某些维度放开。如果电极是固定的，怎么确定分子和电极的初始距离，或者说两电极的距离。谢谢回答！

在做这类的计算之前要几点注意:
1)假设偏压下，分子与电极之间的结合不变。原则上，外加电场会对于分子与电极之间的结合是有影响的。但是要完全的处理，是很难的，难点在于，非平衡态(有偏压或门电压)下，原子所受的力不能再按H-F定理来计算，原子所受的力的计算公式还有待进一步研究。
2)在上面的近似之上，把分子与电极的结合或相互作用，通过slab模型，类似处理分子吸附于电极表面的方式来处理，得到分子与电极的距离和位置构型等。
3)将第2步得到分子与电极相互作用较强的区域一起放到双电极体系(two-probe system)里面的中心区，再在中心区加上一部分表面层(即重复了电极区的原子层)。
赞一下(3人) 回复此楼
5楼2010-05-08 11:58:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+2):3ks 2010-05-08 18:44:19
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-05-20 18:14:13
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-05-08 04:58:08:


在做这类的计算之前要几点注意:
1)假设偏压下，分子与电极之间的结合不变。原则上，外加电场会对于分子与电极之间的结合是有影响的。但是要完全的处理，是很难的，难点在于，非平衡态(有偏压或门电压)下，原 ...

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中间分子受力还是比较大。也就是说吸附的时候，分子是一端受电极的力，另一端自由，而两边的电极都加上之后，分子两端都受力。有结果可以看出来，这样做出来的电极之间的距离还是不是很合适。如果合适的话，采用吸附距离构建的三明治体系中分子受力应该是比较小的。最好的方法就是选取数个电极距离分别优化中间分子，找一个能量最低的距离。但是这样做，太耗时间。
所以这一直是一个问题。
赞一下(4人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
6楼2010-05-08 15:32:25
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

dxqhjj2008

铜虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-07 22:59:54
先把分子优化，再加电极，然后再优化，还不行的话，可以适当修改参数看看，如ForceTolerance  ， MaxSteps           调大一点试试看
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-05-07 16:52:16
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-07 23:00:44
引用回帖:
Originally posted by dxqhjj2008 at 2010-05-07 09:52:16:
先把分子优化，再加电极，然后再优化，还不行的话，可以适当修改参数看看，如ForceTolerance  ， MaxSteps           调大一点试试看

你所谓的加上电极之后在优化，这个阶段电极固定吗？还是电极某些维度放开。如果电极是固定的，怎么确定分子和电极的初始距离，或者说两电极的距离。谢谢回答！
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2010-05-07 16:55:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
同问二楼的问题
回复此楼
4楼2010-05-08 09:13:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangying09

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-08 15:32:25:

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中 ...

我现在用ＡＴＫ，请问一下我可以加你的ＱＱ吗？我也是对优化电极很不理解
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-05-19 15:08:21
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

redhaier

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-05-20 18:14:47
寻找这样一个优化的结构没太大有意义，从实验的角度来说，很多时候电极是被拉伸或者存在应力的，你找到的结构未必能和实验去比对，我想只要大致的成键情况差不太多就行了，所以只要凭经验估计一个距离，然后优化，然后输运计算，得到的结果应该是定性正确的。
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-08 15:32:25:

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中 ...

赞一下(2人) 回复此楼
8楼2010-05-19 19:05:33
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by redhaier at 2010-05-19 12:05:33:
寻找这样一个优化的结构没太大有意义，从实验的角度来说，很多时候电极是被拉伸或者存在应力的，你找到的结构未必能和实验去比对，我想只要大致的成键情况差不太多就行了，所以只要凭经验估计一个距离，然后优化， ...

但是有些体系的电子分布受几何结构的影响很大，尤其是在临界的那些位置。并且分子与电极的接触耦合方式都很大程度上影响着计算的结果。所以这个几何构型还是相当重要的。
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
9楼2010-05-19 19:15:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

redhaier

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
举个例子？
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-19 19:15:37:

但是有些体系的电子分布受几何结构的影响很大，尤其是在临界的那些位置。并且分子与电极的接触耦合方式都很大程度上影响着计算的结果。所以这个几何构型还是相当重要的。

回复此楼
10楼2010-05-19 22:23:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lywhit 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] reject后小感 +7 sioc-sunj 2024-11-14 9/450 2024-11-16 20:49 by zyhou
[教师之家] 评正教授需要两个国家级项目，有人用子课题糊弄，结果在评审前资格公示时被举报拿下了 +25 瞬息宇宙 2024-11-12 38/1900 2024-11-16 20:20 by dxcharlary
[论文投稿] 小论文影响大论文查重吗？ +5 阿道夫深度 2024-11-14 6/300 2024-11-16 19:40 by 冼亮淀粉酶
[考博] 中南大学 粉末冶金国家重点实验室 陈超教授课题组拟招收 1~2位博士研究生通知 +8 中南大学-金属材 2024-11-14 20/1000 2024-11-16 18:45 by 中南大学-金属材
[基金申请] 求助！请问海外博后依托内地单位申请青基的优劣？ 50+3 2280999712 2024-11-15 14/700 2024-11-16 17:30 by dxcharlary
[考博] 联系的博导说有时间聊一聊 我回复了自己可以的时间后 博导就没再回复 +7 evan0489 2024-11-15 7/350 2024-11-16 15:16 by zyqchem
[硕博家园] 实验进度 +10 麻辣烫。 2024-11-11 15/750 2024-11-16 13:49 by machunyude
[精细化工] 同一个反应相同的反应条件，是不是反应结果相差不大？ +6 青霉素 2024-11-11 6/300 2024-11-16 13:35 by linjunc
[第一性原理] 有没有要一起买VASP版权的，可以6个人 5+3 变成小神 2024-11-14 9/450 2024-11-16 13:33 by dxcharlary
[论文投稿] 国内期刊审稿人数量 +4 新时代核动力驴 2024-11-13 6/300 2024-11-16 08:24 by pityzhou
[教师之家] 这种人痛苦吗 +12 2671 2024-11-12 14/700 2024-11-15 22:15 by 仇恨毁灭财富
[论文投稿] OE返修遇到expired +3 隔壁老王来了 2024-11-14 7/350 2024-11-14 20:46 by 隔壁老王来了
[硕博家园] 大龄已婚想读博如何 +15 米娅阳 2024-11-11 18/900 2024-11-14 14:18 by xiaomi0401
[基金申请] 76批博后基金 +3 feiyi3986 2024-11-14 3/150 2024-11-14 11:50 by puly
[基金申请] 第76批博士后面上大概什么时间公示 +6 探际者 2024-11-11 7/350 2024-11-14 10:06 by Foxicut88
[论文投稿] 求JACS和ACIE的最新文章模板 10+4 Jane060390 2024-11-10 4/200 2024-11-13 09:13 by 北京莱茵润色
[基金申请] 浙江省青基怎么看A还是B？ +8 ToallGoof 2024-11-11 14/700 2024-11-13 09:11 by Praybest
[论文投稿] 投稿求助 40+3 liukun11 2024-11-12 4/200 2024-11-12 19:13 by liukun11
[论文投稿] 论文接受后，编辑部发邮件提醒缺少附件 15+4 上善若水明泪 2024-11-10 4/200 2024-11-12 14:24 by 北京莱茵润色
[硕博家园] 同步辐射 +4 小张要加油努力 2024-11-10 7/350 2024-11-11 13:47 by mpdfwxgui
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭