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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】ATK优化计算不收敛怎么办
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lywhit

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】ATK优化计算不收敛怎么办 已有8人参与

SimulationType::Type                              Relaxation
Relaxation::Type                                  CG
Relaxation::MaxSteps                              200                 
Relaxation::ForceTolerance                        0.05000 eV/Ang      
Relaxation::MaxDisplacement                       0.05292 Ang         



计算了2天之后出现如下错误，
ERROR: Failed to relax the system using CG algorithm.

不知该如何解决？
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1楼 2010-04-29 15:10:55
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
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zzy870720z(金币+3):感谢指导 2010-05-20 18:13:43
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-07 16:55:39:

你所谓的加上电极之后在优化，这个阶段电极固定吗？还是电极某些维度放开。如果电极是固定的，怎么确定分子和电极的初始距离，或者说两电极的距离。谢谢回答！

在做这类的计算之前要几点注意:
1)假设偏压下，分子与电极之间的结合不变。原则上，外加电场会对于分子与电极之间的结合是有影响的。但是要完全的处理，是很难的，难点在于，非平衡态(有偏压或门电压)下，原子所受的力不能再按H-F定理来计算，原子所受的力的计算公式还有待进一步研究。
2)在上面的近似之上，把分子与电极的结合或相互作用，通过slab模型，类似处理分子吸附于电极表面的方式来处理，得到分子与电极的距离和位置构型等。
3)将第2步得到分子与电极相互作用较强的区域一起放到双电极体系(two-probe system)里面的中心区，再在中心区加上一部分表面层(即重复了电极区的原子层)。
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5楼2010-05-08 11:58:08
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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wuli8(金币+2):3ks 2010-05-08 18:44:19
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-05-20 18:14:13
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-05-08 04:58:08:


在做这类的计算之前要几点注意:
1)假设偏压下，分子与电极之间的结合不变。原则上，外加电场会对于分子与电极之间的结合是有影响的。但是要完全的处理，是很难的，难点在于，非平衡态(有偏压或门电压)下，原 ...

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中间分子受力还是比较大。也就是说吸附的时候，分子是一端受电极的力，另一端自由，而两边的电极都加上之后，分子两端都受力。有结果可以看出来，这样做出来的电极之间的距离还是不是很合适。如果合适的话，采用吸附距离构建的三明治体系中分子受力应该是比较小的。最好的方法就是选取数个电极距离分别优化中间分子，找一个能量最低的距离。但是这样做，太耗时间。
所以这一直是一个问题。
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弘德明志博学笃行
6楼2010-05-08 15:32:25
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dxqhjj2008

铜虫 (初入文坛)
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gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-07 22:59:54
先把分子优化，再加电极，然后再优化，还不行的话，可以适当修改参数看看，如ForceTolerance  ， MaxSteps           调大一点试试看
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2楼2010-05-07 16:52:16
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-07 23:00:44
引用回帖:
Originally posted by dxqhjj2008 at 2010-05-07 09:52:16:
先把分子优化，再加电极，然后再优化，还不行的话，可以适当修改参数看看，如ForceTolerance  ， MaxSteps           调大一点试试看

你所谓的加上电极之后在优化，这个阶段电极固定吗？还是电极某些维度放开。如果电极是固定的，怎么确定分子和电极的初始距离，或者说两电极的距离。谢谢回答！
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弘德明志博学笃行
3楼2010-05-07 16:55:39
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
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同问二楼的问题
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4楼2010-05-08 09:13:35
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zhangying09

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-08 15:32:25:

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中 ...

我现在用ＡＴＫ，请问一下我可以加你的ＱＱ吗？我也是对优化电极很不理解
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7楼2010-05-19 15:08:21
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redhaier

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-05-20 18:14:47
寻找这样一个优化的结构没太大有意义，从实验的角度来说，很多时候电极是被拉伸或者存在应力的，你找到的结构未必能和实验去比对，我想只要大致的成键情况差不太多就行了，所以只要凭经验估计一个距离，然后优化，然后输运计算，得到的结果应该是定性正确的。
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-08 15:32:25:

偏压下分子的受力的表达式可能不再遵从原来的表达式，但是我们可以把平衡时候的几何结构优化出来啊。如果电极距离的获得采取分子吸附的方式来决定分子与电极之间的距离的话，那么当两边的电极都加上之后，发现中 ...

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8楼2010-05-19 19:05:33
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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引用回帖:
Originally posted by redhaier at 2010-05-19 12:05:33:
寻找这样一个优化的结构没太大有意义，从实验的角度来说，很多时候电极是被拉伸或者存在应力的，你找到的结构未必能和实验去比对，我想只要大致的成键情况差不太多就行了，所以只要凭经验估计一个距离，然后优化， ...

但是有些体系的电子分布受几何结构的影响很大，尤其是在临界的那些位置。并且分子与电极的接触耦合方式都很大程度上影响着计算的结果。所以这个几何构型还是相当重要的。
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弘德明志博学笃行
9楼2010-05-19 19:15:37
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redhaier

金虫 (小有名气)
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举个例子？
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-19 19:15:37:

但是有些体系的电子分布受几何结构的影响很大，尤其是在临界的那些位置。并且分子与电极的接触耦合方式都很大程度上影响着计算的结果。所以这个几何构型还是相当重要的。

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10楼2010-05-19 22:23:39
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