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lywhit

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】ATK优化计算不收敛怎么办 已有8人参与

SimulationType::Type                              Relaxation
Relaxation::Type                                  CG
Relaxation::MaxSteps                              200                 
Relaxation::ForceTolerance                        0.05000 eV/Ang      
Relaxation::MaxDisplacement                       0.05292 Ang         



计算了2天之后出现如下错误,
ERROR: Failed to relax the system using CG algorithm.

不知该如何解决?
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zhangguangping

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by redhaier at 2010-05-19 12:05:33:
寻找这样一个优化的结构没太大有意义,从实验的角度来说,很多时候电极是被拉伸或者存在应力的,你找到的结构未必能和实验去比对,我想只要大致的成键情况差不太多就行了,所以只要凭经验估计一个距离,然后优化, ...

但是有些体系的电子分布受几何结构的影响很大,尤其是在临界的那些位置。并且分子与电极的接触耦合方式都很大程度上影响着计算的结果。所以这个几何构型还是相当重要的。
弘德明志博学笃行
9楼2010-05-19 19:15:37
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dxqhjj2008

铜虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):感谢交流! 2010-05-07 22:59:54
先把分子优化,再加电极,然后再优化,还不行的话,可以适当修改参数看看,如ForceTolerance  , MaxSteps           调大一点试试看
2楼2010-05-07 16:52:16
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):感谢交流! 2010-05-07 23:00:44
引用回帖:
Originally posted by dxqhjj2008 at 2010-05-07 09:52:16:
先把分子优化,再加电极,然后再优化,还不行的话,可以适当修改参数看看,如ForceTolerance  , MaxSteps           调大一点试试看

你所谓的加上电极之后在优化,这个阶段电极固定吗?还是电极某些维度放开。如果电极是固定的,怎么确定分子和电极的初始距离,或者说两电极的距离。谢谢回答!
弘德明志博学笃行
3楼2010-05-07 16:55:39
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
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zzy870720z(金币+3):感谢指导 2010-05-20 18:13:43
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-07 16:55:39:

你所谓的加上电极之后在优化,这个阶段电极固定吗?还是电极某些维度放开。如果电极是固定的,怎么确定分子和电极的初始距离,或者说两电极的距离。谢谢回答!

在做这类的计算之前要几点注意:
1)假设偏压下,分子与电极之间的结合不变。原则上,外加电场会对于分子与电极之间的结合是有影响的。但是要完全的处理,是很难的,难点在于,非平衡态(有偏压或门电压)下,原子所受的力不能再按H-F定理来计算,原子所受的力的计算公式还有待进一步研究。
2)在上面的近似之上,把分子与电极的结合或相互作用,通过slab模型,类似处理分子吸附于电极表面的方式来处理,得到分子与电极的距离和位置构型等。
3)将第2步得到分子与电极相互作用较强的区域一起放到双电极体系(two-probe system)里面的中心区,再在中心区加上一部分表面层(即重复了电极区的原子层)。
5楼2010-05-08 11:58:08
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