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BSSE校正
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我做离解能时用的都是Ezpe值，审稿人建议我替换为free energies evaluating thermal and entropic corrections, 在另外一条意见中提到过最好用BSSE校正。请问，两条意见是否矛盾？我查到的 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE，E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO), 请问E(AB)、E(AO)、E(BO)应取什么值？是否可以取审稿人建议的“free energies evaluating thermal and entropic corrections”？ 谢谢！ |
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ChemiAndy
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2楼2012-02-12 21:19:16
3楼2012-02-13 10:10:37
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
乐逍遥741(金币+10): ★★★很有帮助 2012-02-14 14:30:16
gmy1990(金币+5): 2012-03-08 16:41:46
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gmy1990(金币+5): 2012-03-08 16:41:46
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1. 对头。 2. 合理不合理，要看热力学和熵校正与BSSE的关系。 首先HF总能，或MP2总能，相当于分子的内能U；而热力学校正，即焓的计算是H=U+PV， 自由能G=H-TS，其中熵S是把分子看作刚体计算转动和平动熵，并在简谐近似下计算左右的振动熵，另外考虑电子熵。其中振动熵的贡献占90%以上。进行BSSE，相当于是对焓的内能部分进行修正；而内能修正不影响其他计算结果。 当然，振动熵显然是基于BSSE校正前的能量进行二阶微分得到的，这一部分包含BSSE的误差无法消除，但是这个误差应该小到可以忽略。 因此，我认为合理。 |
4楼2012-02-13 18:00:42
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再问您一个问题哈，如何查找free energies with thermal and entropic corrections？ 我在高斯输出文件中寻找free energies with thermal and entropic corrections，发现没有对应的，如下： Zero-point correction= 0.037424 (Hartree/Particle) Thermal correction to Energy= 0.046197 Thermal correction to Enthalpy= 0.047141 Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.003273 Sum of electronic and zero-point Energies= -414.287768 Sum of electronic and thermal Energies= -414.278995 Sum of electronic and thermal Enthalpies= -414.278051 Sum of electronic and thermal Free Energies= -414.321919 E (Thermal) CV S KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin Total 28.989 28.058 92.327 Electronic 0.000 0.000 0.000 Translational 0.889 2.981 40.186 Rotational 0.889 2.981 26.662 Vibrational 27.212 22.097 25.479 我在下一部分看到有E (Thermal)和S的total 值 28.989和 92.327 ，请问是这两个值分别是thermal and entropic 校正值吗？如果是的话， free energies with thermal and entropic corrections=Etot-28.989-92.327，这样计算对吗？谢谢您！ |
5楼2012-02-14 15:42:50
6楼2012-02-14 16:09:23
ChemiAndy
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乐逍遥7417楼2012-02-14 21:46:00
8楼2012-02-15 10:29:41
10