24小时热门版块排行榜    

查看: 1977  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

乐逍遥741

金虫 (小有名气)

[求助] BSSE校正

我做离解能时用的都是Ezpe值,审稿人建议我替换为free energies evaluating thermal and entropic corrections, 在另外一条意见中提到过最好用BSSE校正。请问,两条意见是否矛盾?我查到的 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO), 请问E(AB)、E(AO)、E(BO)应取什么值?是否可以取审稿人建议的“free energies evaluating thermal and entropic corrections”?
谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


直接取总自由能即可:Sum of electronic and thermal Free Energies=         -414.321919

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-02-14 21:46:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+3): 2012-02-12 22:22:46
乐逍遥741(金币+10): ★★★很有帮助 2012-02-13 09:48:06
不矛盾。BSSE是基组叠加引起的误差,而free energy则是对热效应和熵效应的校正,完全不同来源的校正。

E(AB)、E(AO)、E(BO)就是分别优化AB, A和B得到的总能。当然最好取free energies with thermal and entropic corrections。
2楼2012-02-12 21:19:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐逍遥741

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ChemiAndy at 2012-02-12 21:19:16:
不矛盾。BSSE是基组叠加引起的误差,而free energy则是对热效应和熵效应的校正,完全不同来源的校正。

E(AB)、E(AO)、E(BO)就是分别优化AB, A和B得到的总能。当然最好取free energies with thermal and entrop ...

谢谢您的回答。
E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO),那按照您的意思,对于E(AB)、E(AO)、E(BO),我取free energy,算出 E(相互作用能),然后据式子 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,算出的 E(校正相互作用能)就是审稿人要求我计算的能量喽?
有一个疑惑就是,BSSE不是对HF能量(Etot, total energy)的校正吗?这样计算合理吗?
3楼2012-02-13 10:10:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
乐逍遥741(金币+10): ★★★很有帮助 2012-02-14 14:30:16
gmy1990(金币+5): 2012-03-08 16:41:46
1. 对头。

2. 合理不合理,要看热力学和熵校正与BSSE的关系。

首先HF总能,或MP2总能,相当于分子的内能U;而热力学校正,即焓的计算是H=U+PV, 自由能G=H-TS,其中熵S是把分子看作刚体计算转动和平动熵,并在简谐近似下计算左右的振动熵,另外考虑电子熵。其中振动熵的贡献占90%以上。进行BSSE,相当于是对焓的内能部分进行修正;而内能修正不影响其他计算结果。

当然,振动熵显然是基于BSSE校正前的能量进行二阶微分得到的,这一部分包含BSSE的误差无法消除,但是这个误差应该小到可以忽略。

因此,我认为合理。
4楼2012-02-13 18:00:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:19 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WQyTGMbfH7Cx 2026-08-07 4/200 2026-08-08 15:02 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见