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乐逍遥741

金虫 (小有名气)

[求助] BSSE校正

我做离解能时用的都是Ezpe值,审稿人建议我替换为free energies evaluating thermal and entropic corrections, 在另外一条意见中提到过最好用BSSE校正。请问,两条意见是否矛盾?我查到的 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO), 请问E(AB)、E(AO)、E(BO)应取什么值?是否可以取审稿人建议的“free energies evaluating thermal and entropic corrections”?
谢谢!
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乐逍遥741

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 乐逍遥741 at 2012-02-14 15:42:50:
再问您一个问题哈,如何查找free energies with thermal and entropic corrections?
我在高斯输出文件中寻找free energies with thermal and entropic corrections,发现没有对应的,如下:

Zero-point co ...

我意识到自己后部分说的不对
如何查找free energies with thermal and entropic corrections?
6楼2012-02-14 16:09:23
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查看全部 8 个回答

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+3): 2012-02-12 22:22:46
乐逍遥741(金币+10): ★★★很有帮助 2012-02-13 09:48:06
不矛盾。BSSE是基组叠加引起的误差,而free energy则是对热效应和熵效应的校正,完全不同来源的校正。

E(AB)、E(AO)、E(BO)就是分别优化AB, A和B得到的总能。当然最好取free energies with thermal and entropic corrections。
2楼2012-02-12 21:19:16
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乐逍遥741

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ChemiAndy at 2012-02-12 21:19:16:
不矛盾。BSSE是基组叠加引起的误差,而free energy则是对热效应和熵效应的校正,完全不同来源的校正。

E(AB)、E(AO)、E(BO)就是分别优化AB, A和B得到的总能。当然最好取free energies with thermal and entrop ...

谢谢您的回答。
E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO),那按照您的意思,对于E(AB)、E(AO)、E(BO),我取free energy,算出 E(相互作用能),然后据式子 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,算出的 E(校正相互作用能)就是审稿人要求我计算的能量喽?
有一个疑惑就是,BSSE不是对HF能量(Etot, total energy)的校正吗?这样计算合理吗?
3楼2012-02-13 10:10:37
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
乐逍遥741(金币+10): ★★★很有帮助 2012-02-14 14:30:16
gmy1990(金币+5): 2012-03-08 16:41:46
1. 对头。

2. 合理不合理,要看热力学和熵校正与BSSE的关系。

首先HF总能,或MP2总能,相当于分子的内能U;而热力学校正,即焓的计算是H=U+PV, 自由能G=H-TS,其中熵S是把分子看作刚体计算转动和平动熵,并在简谐近似下计算左右的振动熵,另外考虑电子熵。其中振动熵的贡献占90%以上。进行BSSE,相当于是对焓的内能部分进行修正;而内能修正不影响其他计算结果。

当然,振动熵显然是基于BSSE校正前的能量进行二阶微分得到的,这一部分包含BSSE的误差无法消除,但是这个误差应该小到可以忽略。

因此,我认为合理。
4楼2012-02-13 18:00:42
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