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双酶切问题
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joan198108
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[交流]
双酶切问题
双酶切质粒载体,酶切完全后得到两个片段:约5000bp和100bp,通常回收PCR不容易检测到100bp的条带,这样就不容易区分大片段是双酶切后产物的还是单酶切产物。当然,采用高浓度凝胶可以检测出100bp的条带,不知道还有没有其他简单易行的方法进行区分呢,欢迎指教。
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2012-02-07 10:54:59
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joan198108
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Originally posted by
cxl_yll
at 2012-02-09 09:01:14:
跑一个单酶切的,跑一个双酶切的,在一个胶上跑,双酶切的比单酶切的要低一点。我用这个方法检测过相差200bp的,没有问题。是不是能多送我金币啊~~
我的只是相差100bp,并且另一个片段5000bp+,上面的方法恐怕是不太容易观察。金币就不送了,给朵小红花吧,呵呵
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10楼
2012-02-09 09:36:23
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香菱儿
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★
joan198108(金币
+1
):谢谢参与
跑PAGE胶
胶回收自连
酶切载体是为了克隆吧,直接往下做,再做一个自连对照看看
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2012-02-07 12:49:58
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brightfuture01
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joan198108(金币
+1
):谢谢参与
看天(金币+2): 鼓励交流 2012-02-07 13:20:36
常用的一些高效率的限制性内切酶如BamHI、EcoRI等酶切几个小时就完全酶切了,你所提到的这个问题就不存在。如果是低效率的限制性内切酶,最好过夜酶切。
最好能切胶回收5000bp的酶切产物,毕竟你的另一段有100bp。
前些年的时候国产试剂盒的质量比较差,虽说能回收100以上的DNA片段,但是基本上回收不到100bp。现在国产试剂盒的质量也比较高了,100bp的片段过PCR柱纯化试剂盒残留太多,连接很容易重新连回到载体上。‘
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3楼
2012-02-07 13:01:21
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joan198108
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楼
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香菱儿
at 2012-02-07 12:49:58:
跑PAGE胶
胶回收自连
酶切载体是为了克隆吧,直接往下做,再做一个自连对照看看
自连是个不错的方法,比较直观,就是操作复杂了些。谢谢指教!
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4楼
2012-02-07 13:21:12
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