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bqbcx

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] MOFs簇合物的拓扑解析结果

最近在研究 Zn MOFs簇合物的拓扑解析,所解析的Zn MOFs簇合物中只有一种有机桥连配体,结构分析表明,其MOFs簇合物单元(subs)连接了19个有机配体。以此MOFs簇合物单元为节点,topos 拓扑解析结果也显示MOFs簇合物节点连接数是19。
请问MOFs簇合物的拓扑解析结果中的连接数目,是否一定要与MOFs簇合物单元(subs)中的连接配体数目一致?如果不一致,是不是表明拓扑解析结果错误?(注意:前提条件是只含有一种有机桥连配体)
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bqbcx

铁杆木虫 (正式写手)

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引用回帖:
: Originally posted by wbulu at 2012-02-05 20:22:45:
楼主的一个簇桥连19个配体,但是应该检查是否桥连周围19个金属簇,如果不是,那结构就不是19连接拓扑。根据经验,一定会有两个或以上配体同时桥连到一个周围的簇上,这样topos的分析就是错误的了。

首先谢谢这位网友的应助,具体情形是这样的:
   单晶结构分析表明,其中一个晶体是由7个金属M(其中包括对称操作产生的金属)为中心所形成的3D结构。进一步分析表明,7个M被5个羟基所桥连。如果以M7O5作为金属簇节点,则该节点又被周围19个有机桥连配体所连接。分别以M7O5、有机桥连配体作为节点,通过topos软件操作发现,其拓扑结构是M-19连接的。
   通过文献查阅可知:M-8、M-9、M-10、M-11、M-12、M-13、M-14、M-16、M-24、M-36连接的MOFs都有文献报道(也不知文献报道是否正确,其疑点源于一个前辈所说“不同的节点选择,一定会有不同的拓扑结果”)。
   而本结构中的节点选择应该没有问题, 只是出现的“M-19连接”是个罕见物。而对于其它类似晶体来说,我采用同样的topos拓扑处理方法,得出的拓扑结果也都显现出同样的规律,即MOFs簇合物的拓扑解析结果中的连接数目,都与MOFs簇合物单元(subs)中的连接配体数目一致。只不过,这些晶体所得出的topos结果中连接数都有文献报道过(如6、8、10等)。所以在“19连接”这个罕见物出现之前,我一直没有对自己的topos拓扑处理方法的正确性产生怀疑。
  正如应助者所言,M7O5节点周围的19个有机桥连配体,有部分配体同时桥连到另一个周围的M7O5簇上,但这种情况是不是也很正常的啊,否则此有机配体(即另一个节点)就不会称为桥连配体了(当然了,此有机配体一定有别于羟基)。
  另外,如何理解“应该检查是否桥连周围19个金属簇”?
6楼2012-02-05 22:15:26
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mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
bqbcx(金币+2): 有帮助 2012-02-05 20:54:50
我认为应以topos 拓扑计算结果为准。
2楼2012-02-05 14:40:36
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xwbd04551

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
bqbcx(金币+2): 有帮助 2012-02-05 20:53:02
最好根据计算结果来分析
3楼2012-02-05 15:06:46
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wbulu

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我的建议是不要完全以topos分析结果为准,除非楼主是topos的高手,一定要结合结构分析来定拓扑,要不然结果有时会是错误的。
4楼2012-02-05 20:20:54
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