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bqbcx铁杆木虫 (正式写手)
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MOFs簇合物的拓扑解析结果
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最近在研究 Zn MOFs簇合物的拓扑解析，所解析的Zn MOFs簇合物中只有一种有机桥连配体，结构分析表明，其MOFs簇合物单元（subs）连接了19个有机配体。以此MOFs簇合物单元为节点，topos 拓扑解析结果也显示MOFs簇合物节点连接数是19。 请问MOFs簇合物的拓扑解析结果中的连接数目，是否一定要与MOFs簇合物单元（subs）中的连接配体数目一致？如果不一致，是不是表明拓扑解析结果错误？（注意：前提条件是只含有一种有机桥连配体） |
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bqbcx
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首先谢谢这位网友的应助，具体情形是这样的： 单晶结构分析表明，其中一个晶体是由7个金属M（其中包括对称操作产生的金属）为中心所形成的3D结构。进一步分析表明，7个M被5个羟基所桥连。如果以M7O5作为金属簇节点，则该节点又被周围19个有机桥连配体所连接。分别以M7O5、有机桥连配体作为节点，通过topos软件操作发现，其拓扑结构是M-19连接的。 通过文献查阅可知：M-8、M-9、M-10、M-11、M-12、M-13、M-14、M-16、M-24、M-36连接的MOFs都有文献报道（也不知文献报道是否正确，其疑点源于一个前辈所说“不同的节点选择，一定会有不同的拓扑结果”）。 而本结构中的节点选择应该没有问题, 只是出现的“M-19连接”是个罕见物。而对于其它类似晶体来说，我采用同样的topos拓扑处理方法，得出的拓扑结果也都显现出同样的规律，即MOFs簇合物的拓扑解析结果中的连接数目，都与MOFs簇合物单元（subs）中的连接配体数目一致。只不过，这些晶体所得出的topos结果中连接数都有文献报道过（如6、8、10等）。所以在“19连接”这个罕见物出现之前，我一直没有对自己的topos拓扑处理方法的正确性产生怀疑。 正如应助者所言，M7O5节点周围的19个有机桥连配体，有部分配体同时桥连到另一个周围的M7O5簇上，但这种情况是不是也很正常的啊，否则此有机配体（即另一个节点）就不会称为桥连配体了（当然了，此有机配体一定有别于羟基）。 另外，如何理解“应该检查是否桥连周围19个金属簇”？ |
6楼2012-02-05 22:15:26
mashulin
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【答案】应助回帖
bqbcx(金币+6): ★★★★★最佳答案 2012-02-06 02:00:54
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"应该检查是否桥连周围19个金属簇"是基于你所用的有机配体是不是线性二桥连配体而言的，如果有机配体是线性二桥连的，就可以把M7O5作为节点来简化结构，再如果每个M7O5周围桥连19个M7O5的话，你的结构就是一个单节19连接拓扑。 但如果你的配体不是一个线性二桥连配体，那么简化时就应该把配体也算作一种节点，那么拓扑就不是一个单节拓扑。可能是一个（n，19）的网络。就是这个意思。 我分析，你的拓扑很可能是一个多节的拓扑，比如（3,19）或（4,19）的拓扑。 |
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7楼2012-02-06 00:29:58
bqbcx
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