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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 一个关于全基因组测序的问题
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liuxus20030704

银虫 (小有名气)

[求助] 一个关于全基因组测序的问题

一种原产于我国的经济林木，具有重要的开发价值，包括抗病性、特殊的果实品质等，现在想对其深度开发。本人不是学分子生物学的，想请教一下是否有必要对其进行全基因组测序？测序后有什么重要的应用意义？成本几何？研究成果能发表在哪种级别的期刊上？谢谢大侠指导。临近年关，祝各位大侠春节快乐，回复为盼。
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1楼 2012-01-19 10:22:14
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jinwozzf

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-04 13:44:43
倘若经费充足的话做全基因组测序肯定最好，倘若经费有限需要省着花可以做转目标区域捕获测序，或者外显子测序，看你的关注点如何。
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6楼2012-05-04 12:10:08
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2012-01-19 18:14:54
这个物种的基因组估计有多大？打算测成什么样子（比如覆盖度啥的）？有多少预算？
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2楼2012-01-19 18:04:06
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+4, 专家考核): Good！专家辛苦哈~ 2012-01-20 14:09:35
你的物种是几倍体啊？基因组有多大？
全基因测序当然非常有意义，对重要基因的图位克隆，生物信息学，比较基因组等都非常有意义哈。但是，全基因组测序耗费较大，一般实验室承受不了，不过PAPER可以发的比较高，一般都是SCIENCE，NATURE级别的。
楼主也可以重点盯住抗病和果实品质等性状做些研究，例如基因的MAP或者QTL等。
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3楼2012-01-20 09:42:28
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张晓洁

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
全基因组测序开发SSR和ＳＮＰ标记构建遗传图谱，做比较遗传图谱；寻找候选基因。
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每一发奋努力的背后必有加倍的赏赐
4楼2012-03-25 18:33:11
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