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liuxus20030704

银虫 (小有名气)

[求助] 一个关于全基因组测序的问题

一种原产于我国的经济林木,具有重要的开发价值,包括抗病性、特殊的果实品质等,现在想对其深度开发。本人不是学分子生物学的,想请教一下是否有必要对其进行全基因组测序?测序后有什么重要的应用意义?成本几何?研究成果能发表在哪种级别的期刊上?谢谢大侠指导。临近年关,祝各位大侠春节快乐,回复为盼。
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


西瓜(金币+1): 鼓励交流 2012-01-19 18:14:54
这个物种的基因组估计有多大?打算测成什么样子(比如覆盖度啥的)?有多少预算?
2楼2012-01-19 18:04:06
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+4, 专家考核): Good!专家辛苦哈~ 2012-01-20 14:09:35
你的物种是几倍体啊?基因组有多大?
全基因测序当然非常有意义,对重要基因的图位克隆,生物信息学,比较基因组等都非常有意义哈。但是,全基因组测序耗费较大,一般实验室承受不了,不过PAPER可以发的比较高,一般都是SCIENCE,NATURE级别的。
楼主也可以重点盯住抗病和果实品质等性状做些研究,例如基因的MAP或者QTL等。
3楼2012-01-20 09:42:28
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张晓洁

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
全基因组测序开发SSR和SNP标记构建遗传图谱,做比较遗传图谱;寻找候选基因。
每一发奋努力的背后必有加倍的赏赐
4楼2012-03-25 18:33:11
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caolingdog

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
关键看楼主想干什么?有什么科学问题需要解决?经费是否充足等。
5楼2012-04-02 15:13:01
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jinwozzf

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-04 13:44:43
倘若经费充足的话做全基因组测序肯定最好,倘若经费有限需要省着花可以做转目标区域捕获测序,或者外显子测序,看你的关注点如何。
6楼2012-05-04 12:10:08
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小芽芯

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

7楼2013-03-15 11:14:20
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