24小时热门版块排行榜    

查看: 6356  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

凌-强

银虫 (小有名气)

[求助] 细菌多样性,构建系统进化树中如何选择outgroup?急!!!!!!!

大侠们:
    小弟目前遇到的问题,我做的是肠道细菌多样性,在构建系统进化树的时候,用的是MEGA4.0,采用N-J法,需要选择一个outgroup,这个到底该怎么选择?我是一点头绪都不清楚,由于我的文章已经是处于返修了,所以很紧急,希望有人能帮我解决这个问题。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

国青lihe

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2012-01-16 09:17:18
outgroup就是外群,选择和你的序列相近的种作为外群构建系统发育树!
4楼2012-01-13 23:09:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

sunlblove

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
mega里没看见有这个参数呀  或许我没有找到,恭喜楼主啊  希望贴上 后续
2楼2012-01-13 10:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

痴客

木虫 (正式写手)

吃货250

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2012-01-16 09:17:10
outgroup?不知道是不是说的bootstrap,如果是这个,参数值是1000,自己是这么做的
因为这个世界上这么多的狼,我这只牧羊犬只好放弃我的温顺,向着这个世界放出最耀眼的光。
3楼2012-01-13 21:44:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

frankerry

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2012-01-16 09:17:24
解决了吗?看参考文献,和研究目标菌属存在较大差异的其他属模式菌的序列加到你的建树序列中,重新建树所得到的发育树。
5楼2012-01-16 09:14:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 8/400 2026-03-17 19:03 by Wangjingyue
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 289求调剂 +6 步川酷紫123 2026-03-11 6/300 2026-03-17 10:23 by Sammy2
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家,不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见