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jinjl174

木虫 (正式写手)

[求助] 计算MS里的Polymorph遇到问题

各位虫友,有谁用过MS里的Ploymorph吗?
我在使用Ploymorph中的Predict预测有机分子多晶时,分子构型总是变形扭曲,苯环都扭曲了。

我是使用DMol3计算了分子的静电势,然后再进行Ploymorph运算的,结果如上所述,请问,有什么解决的方法?本人是MS的新手一枚。
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sigmax

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+1): 多谢提示 2012-01-13 13:10:09
有机分子本身要做刚性固定,否则变动参数太多,跑不出来。这个模块做多晶预测,国外是用64-256CPU的集群来做的,计算量太大。基本不实用。关键是预测的能量函数不好计算,用CASTEP或DMOL3比较准确一些,但是计算机时不敢想象。
2楼2012-01-13 12:46:40
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韩旭辉

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sigmax at 2012-01-13 12:46:40
有机分子本身要做刚性固定,否则变动参数太多,跑不出来。这个模块做多晶预测,国外是用64-256CPU的集群来做的,计算量太大。基本不实用。关键是预测的能量函数不好计算,用CASTEP或DMOL3比较准确一些,但是计算机时 ...

能不能请问一下:MS中有机分子本身要做刚性固定要怎么做啊?我遇到同样的问题?
NAFION
3楼2015-10-18 20:42:50
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大大的小天蝎

至尊木虫 (正式写手)

我就问问 这在普通的计算机上平跑的起来吗?您有那个模块的教程吗?
4楼2015-11-24 18:52:22
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Real穗

银虫 (小有名气)

请教楼主,DMol3中如何计算静电势?谢谢!求教程
5楼2019-04-03 17:21:28
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