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jinjl174

木虫 (正式写手)

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[求助] 计算MS里的Polymorph遇到问题

各位虫友，有谁用过MS里的Ploymorph吗？
我在使用Ploymorph中的Predict预测有机分子多晶时，分子构型总是变形扭曲，苯环都扭曲了。

我是使用DMol3计算了分子的静电势，然后再进行Ploymorph运算的，结果如上所述，请问，有什么解决的方法？本人是MS的新手一枚。

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1楼 2012-01-05 11:05:05

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sigmax

银虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang(金币+1): 多谢提示 2012-01-13 13:10:09

有机分子本身要做刚性固定，否则变动参数太多，跑不出来。这个模块做多晶预测，国外是用64-256CPU的集群来做的，计算量太大。基本不实用。关键是预测的能量函数不好计算，用CASTEP或DMOL3比较准确一些，但是计算机时不敢想象。

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2楼2012-01-13 12:46:40

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韩旭辉

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引用回帖:

2楼: Originally posted by sigmax at 2012-01-13 12:46:40
有机分子本身要做刚性固定，否则变动参数太多，跑不出来。这个模块做多晶预测，国外是用64-256CPU的集群来做的，计算量太大。基本不实用。关键是预测的能量函数不好计算，用CASTEP或DMOL3比较准确一些，但是计算机时 ...

能不能请问一下：MS中有机分子本身要做刚性固定要怎么做啊？我遇到同样的问题？

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