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[求助]
分子对接 如何用Chemdraw绘制mol格式的小分子配体 已有2人参与
求助各方高手:
我刚开始学做分子对接,蛋白的pdb文件已经获得,但对于三肽配体Met-Leu-Phe,我是自己用Chemdraw画的,是不是可以直接用模板里的单个氨基酸生成?我不知道该怎样完成两个氨基酸之间的脱水过程,所以就重新挨个键画的,最后存成mol格式。
但我在用iGEMDOCK完成对接时,系统提示:
fMLF.mol is not a correct list file
An accetpable list file MUST contain drug location in each line in it
应该是配体数据不对。我是少了什么步骤吗?是不是还需要什么二维到三维的转化过程?
恳请大家指点! |
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