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分子对接 如何用Chemdraw绘制mol格式的小分子配体 已有2人参与
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求助各方高手： 我刚开始学做分子对接，蛋白的pdb文件已经获得，但对于三肽配体Met-Leu-Phe，我是自己用Chemdraw画的，是不是可以直接用模板里的单个氨基酸生成？我不知道该怎样完成两个氨基酸之间的脱水过程，所以就重新挨个键画的，最后存成mol格式。 但我在用iGEMDOCK完成对接时，系统提示： fMLF.mol is not a correct list file An accetpable list file MUST contain drug location in each line in it 应该是配体数据不对。我是少了什么步骤吗？是不是还需要什么二维到三维的转化过程? 恳请大家指点！ |
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3楼2014-02-20 19:40:45
beaubear
银虫 (初入文坛)
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- 专业: 食品科学基础
2楼2014-02-19 11:15:59