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c3024034

银虫 (正式写手)

[求助] 点突变后蛋白结构变化预测

现在我做了一个蛋白的一系列赖氨酸突变体,我想看一下蛋白的结构是否发生了变化,请问有什么比较简单的软件可用啊?最好是输入氨基酸序列就可以出结构的,太复杂的我也不会,如果有人会的话,帮我弄一下也好,谢谢
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imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5): good! 2011-12-27 20:13:49
西瓜(金币+1, MolEPI+1): EPI补上,请笑纳^_^ 2011-12-28 13:00:47
swiss-model进行模建的话,肯定不会有大影响,除非你的的氨基酸位点对空间十分重要,就像血红细胞的那个突变一下。但是i可能性不大,如果你想精确分析的话,还是用一些专业软件比较好,比如DS里面就有定点突变模块,还用pp,它是和DS连用的,还用MOE,精度会差点,最好就是模建之后跑个动力学进行一下优化,总之如果要求高的话,整个过程还是很繁琐的。建议找个认识的生物信息学的朋友帮帮忙。
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
10楼2011-12-25 15:51:52
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普通回帖

c3024034

银虫 (正式写手)

没高手啊?
2楼2011-12-21 14:13:27
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

没做过,帮顶下~您可以看下帖子下面的
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3楼2011-12-21 18:56:18
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
c3024034(金币+3): ★★★很有帮助 2011-12-22 13:14:25
西瓜(金币+3): Good! 2011-12-23 23:37:25
最简单的当然是用SWISS-MODEN在线建模,但个别氨基酸突变后结构不一定有明显变化的。
4楼2011-12-21 22:16:24
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c3024034

银虫 (正式写手)

引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-12-21 22:16:24:
最简单的当然是用SWISS-MODEN在线建模,但个别氨基酸突变后结构不一定有明显变化的。

请问这个SWISS-MODEN在线建模,应该怎么做呢?
5楼2011-12-22 13:14:15
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

c3024034(金币+4): 2011-12-23 14:16:27
提交氨基酸序列就好了
6楼2011-12-22 16:04:43
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lilihuang1125

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
c3024034(金币+3): 2011-12-23 14:16:19
西瓜(金币+2): 鼓励应助! 2011-12-23 23:37:32
http://swissmodel.expasy.org/wor ... _simple1&userid
LZ点这个网页,提交你的氨基酸序列就可以
7楼2011-12-23 11:33:39
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tyl681108

木虫 (著名写手)

送鲜花一朵
估计不会有什么结果
8楼2011-12-23 21:52:04
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zuoyue911

禁虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+4): 讲得有道理 2011-12-27 20:13:24
本帖内容被屏蔽

9楼2011-12-25 13:31:11
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