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点突变后蛋白结构变化预测
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| 现在我做了一个蛋白的一系列赖氨酸突变体,我想看一下蛋白的结构是否发生了变化,请问有什么比较简单的软件可用啊?最好是输入氨基酸序列就可以出结构的,太复杂的我也不会,如果有人会的话,帮我弄一下也好,谢谢 |
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imyting
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5): good! 2011-12-27 20:13:49
西瓜(金币+1, MolEPI+1): EPI补上,请笑纳^_^ 2011-12-28 13:00:47
wanhscn(金币+5): good! 2011-12-27 20:13:49
西瓜(金币+1, MolEPI+1): EPI补上,请笑纳^_^ 2011-12-28 13:00:47
| swiss-model进行模建的话,肯定不会有大影响,除非你的的氨基酸位点对空间十分重要,就像血红细胞的那个突变一下。但是i可能性不大,如果你想精确分析的话,还是用一些专业软件比较好,比如DS里面就有定点突变模块,还用pp,它是和DS连用的,还用MOE,精度会差点,最好就是模建之后跑个动力学进行一下优化,总之如果要求高的话,整个过程还是很繁琐的。建议找个认识的生物信息学的朋友帮帮忙。 |

10楼2011-12-25 15:51:52
西瓜
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lxj341401
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