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c3024034

银虫 (正式写手)

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[求助] 点突变后蛋白结构变化预测

现在我做了一个蛋白的一系列赖氨酸突变体，我想看一下蛋白的结构是否发生了变化，请问有什么比较简单的软件可用啊？最好是输入氨基酸序列就可以出结构的，太复杂的我也不会，如果有人会的话，帮我弄一下也好，谢谢

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1楼 2011-12-21 11:13:57

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imyting

至尊木虫 (正式写手)

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专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5): good！ 2011-12-27 20:13:49
西瓜(金币+1, MolEPI+1): EPI补上，请笑纳^_^ 2011-12-28 13:00:47

swiss-model进行模建的话，肯定不会有大影响，除非你的的氨基酸位点对空间十分重要，就像血红细胞的那个突变一下。但是i可能性不大，如果你想精确分析的话，还是用一些专业软件比较好，比如DS里面就有定点突变模块，还用pp，它是和DS连用的，还用MOE,精度会差点，最好就是模建之后跑个动力学进行一下优化，总之如果要求高的话，整个过程还是很繁琐的。建议找个认识的生物信息学的朋友帮帮忙。