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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何计算下面几个有机小分子的大小？
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lynchpku

金虫 (正式写手)

[求助] 如何计算下面几个有机小分子的大小？

本人对模拟完全是门外汉。呵呵。
现在课题需要计算几个分子结构。一个是油酸分子，一个是胆固醇分子。（下图附件）想知道它们的分子大小。
另外还想知道如果单纯一个烷基分子大概要多少个C原子的长度能够与这两个分子相当？
最好能详细点的计算步骤，谢谢！

如果有大侠能算好，我将不胜感激。呵呵
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1楼2011-12-21 10:42:54
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lynchpku

金虫 (正式写手)
补充一下，手头有 Chem 3D。不过不知道怎么算？
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2楼2011-12-21 10:48:48
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lynchpku

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by chf220284 at 2011-12-22 11:45:44:
选择两端的原子。右键点击其中一个。右键菜单最后一个：Display Distance Measurement

测距离

恩，正是我想要的。不过不知道为啥不能给奖励呢？先送剁鲜花表示感谢吧！
另外还有个小问题，测量前是否需要能量优化？好像有个MM2的？
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6楼2011-12-23 14:52:37
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lynchpku

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by yongleli at 2011-12-23 15:37:00:
对了，Chem3D可以跟GAMESS或者Gaussian联用，
推荐用B3LYP/6-31G*水平计算，再加一个关键字volume。

好的。学习了，我先自己鼓捣鼓捣，不行的话再来向大侠请教！！
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9楼2011-12-26 09:59:44
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