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【求助】帮忙算一个有机小分子的长度和宽度
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bingling1012
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【求助】帮忙算一个有机小分子的长度和宽度
请高手帮忙计算一下这个有机小分子的长度和宽度,好像是用高斯理论算的,先谢过了!
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1楼
2011-01-18 20:22:34
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分子的长度和宽度?该怎么定义?不懂的飘过...
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2楼
2011-01-18 21:14:28
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sunhaitao
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请教算长度和宽度作甚?
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3楼
2011-01-18 22:13:11
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bingling1012
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Originally posted by
bingling1012
at 2011-01-18 20:22:34:
请高手帮忙计算一下这个有机小分子的长度和宽度,好像是用高斯理论算的,先谢过了!
好像可以按直链来计算,应该在二十几个埃,看见过类似的小分子,人家的文章中都算出了分子长度。
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4楼
2011-01-19 08:41:29
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bingling1012
at 2011-01-18 20:22:34:
请高手帮忙计算一下这个有机小分子的长度和宽度,好像是用高斯理论算的,先谢过了!
我觉得可以这样作:由高斯用小基组算一下这个分子,可以得到fch文件,将fch用cubegen或者multiwfn求一次电荷密度,让程序自选格点参数,就会自动得到xyz三个方向的长度。
这是量子化学的长度。因为最边缘的原子,它的波函数还会延展几个埃,这种波函数延展,也是分子起作用的距离,不也是要考虑到分子的长度里面吗?高斯充分考虑了这种延展。(当然高斯考虑装下这个分子时的空间会过大一些,会多出几埃,但对于这么长的分子,这几埃也算不了什么。何况波函数在空间的延展理论上是无限的。)
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Last edited by zhou2009 on 2011-1-19 at 09:39
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5楼
2011-01-19 09:08:57
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zhou2009
at 2011-01-19 09:08:57:
我觉得可以这样作:由高斯用小基组算一下这个分子,可以得到fch文件,将fch用cubegen或者multiwfn求一次电荷密度,让程序自选格点参数,就会自动得到xyz三个方向的长度。
这是量子化学的长度。因为最边缘的 ...
谢谢版主的解答,只是不知道能否帮我算一下呢,我对这些东西了解的很少而且软件都没有,我可以增加金币的,先谢了!
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6楼
2011-01-19 16:41:16
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Originally posted by
bingling1012
at 2011-01-19 16:41:16:
谢谢版主的解答,只是不知道能否帮我算一下呢,我对这些东西了解的很少而且软件都没有,我可以增加金币的,先谢了!
我起码十天之内不能算题,要外出。
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7楼
2011-01-19 17:11:36
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zhou2009
at 2011-01-19 17:11:36:
我起码十天之内不能算题,要外出。
没关系的,我不是很急,等你有时间的时候再帮我算吧,谢谢啦!
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8楼
2011-01-19 20:44:40
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zhou2009(金币+2): 说得对! 2011-01-20 07:16:53
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9楼
2011-01-19 21:14:02
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bingling1012
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ganlh
at 2011-01-19 21:14:02:
这是非刚性结构,长度算来貌似没有多大参考意义。
只要有Chem3D或Hyperchem 构造好之后,几分钟就得到大致的结果,用Gaussian软件算没有必要。
哦,这样啊,不知道能不能说的再详细点呢,是要把它的空间结构画出来吗?
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10楼
2011-01-20 08:31:10
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zhou2009(金币+1): 2011-01-25 08:57:13
bingling1012(金币+5): 2011-02-22 08:19:24
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bingling1012
at 2011-01-20 08:31:10:
哦,这样啊,不知道能不能说的再详细点呢,是要把它的空间结构画出来吗?
在chemdraw中画出分子结构,拷进chem3D中,用最简单的方法优化一下,然后在笛卡尔坐标下你就能估计出分子的长度和宽度了
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12楼
2011-01-24 19:41:44
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minisun
at 2011-01-24 11:41:44:
在chemdraw中画出分子结构,拷进chem3D中,用最简单的方法优化一下,然后在笛卡尔坐标下你就能估计出分子的长度和宽度了
不好意思, 因为放假回家了所以这么久才回复,谢啦!
[
Last edited by bingling1012 on 2011-2-22 at 08:20
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13楼
2011-02-22 08:19:13
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pumf
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
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12楼
:
Originally posted by
minisun
at 2011-01-24 19:41:44:
在chemdraw中画出分子结构,拷进chem3D中,用最简单的方法优化一下,然后在笛卡尔坐标下你就能估计出分子的长度和宽度了
您好,在Chem3d中,优化了一个分子后,怎么出现笛卡尔坐标啊?多谢啦?
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14楼
2011-12-08 10:45:29
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11楼
2011-01-20 09:27
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Originally posted by
bingling1012
at 2011-01-20 08:31:10: 哦,这样啊,不知道能不能说的再详细点呢,是要把它的空间结构画出来吗?
是
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