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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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qwky2010

金虫 (著名写手)


[交流] 酶二级三级结构测定方法

如题,查了下资料,不是太懂,请教下,一帮情况下,二级结构测定,三级结构测定通常分别用什么方法,或者结合使用测定,另外对于酶的结构分析以及催化位点,活性位点什么的分析还需要做哪些工作呢,请教下达人,谢谢了
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imyting

至尊木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
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qwky2010(金币+15): 真诚谢谢了啊 2011-12-14 15:36:12
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good! 2011-12-14 19:47:22
二级结构的含量可以用圆二色谱法进行测定,三级结构如果PDB数据库中没有的话,可以用两种办法获得:1.使用计算机软件进行同源模建,以及通过动力学进行精制;2.通过实验方法获得晶体,好像上海那边可以解析晶体结构。不过第二种方法比较难,养晶本身就是个概率事件。至于酶的结构分析以及催化位点,活性位点的分析,再得到三级结构之后可以通过计算机软件进行对接,再分析受体交联作用来分析。一般情况下只要三级结构没太大的问题,结构都是比较准确的。

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5楼2011-12-14 13:21:26
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普通回帖

hewensen

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★
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wanhscn(金币+2): 鼓励交流!GOOD! 2011-12-14 12:40:20
貌似这个问题应该很难的,我也很想知道答案呢,有的酶的结构可以在网上查到的,楼主不妨试试蛋白数据库http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
2楼2011-12-14 12:25:13
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lindasunhui

金虫 (小有名气)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-12-14 19:47:42
二级结构用SELCON3程序解析,三级结构我也不知道。
3楼2011-12-14 13:07:21
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pophust

金虫 (初入文坛)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+1): 鼓励 2011-12-14 19:47:56
内容已删除
4楼2011-12-14 13:15:01
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qwky2010

金虫 (著名写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by imyting at 2011-12-14 13:21:26:
二级结构的含量可以用圆二色谱法进行测定,三级结构如果PDB数据库中没有的话,可以用两种办法获得:1.使用计算机软件进行同源模建,以及通过动力学进行精制;2.通过实验方法获得晶体,好像上海那边可以解析晶体结 ...

真诚谢谢啊~
6楼2011-12-14 15:31:55
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小小亚杰

木虫 (正式写手)


过来学习了
7楼2011-12-14 22:00:25
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yaomengche

铜虫 (正式写手)


过来学习的
8楼2011-12-15 10:10:23
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半步一生

新虫 (初入文坛)


★ ★ ★ ★
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西瓜(金币+3): 鼓励交流! 2011-12-31 22:11:05
qwky2010(金币+5): 感谢分享 2012-01-01 10:04:59
我知道几个二级结构和三级结构预测网站,
Phyre,Swiss这两个在线分析网站,对于新手来说用用不错,同源数据库蛮全的。
9楼2011-12-31 16:52:55
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曙光无限

新虫 (正式写手)


169838178  欢迎加群 一同学习酶 另外欢迎邀请您身边的好友一同学习
10楼2014-10-21 15:33:56
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