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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 酶二级三级结构测定方法
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qwky2010

金虫 (著名写手)

[交流] 酶二级三级结构测定方法

如题，查了下资料，不是太懂，请教下，一帮情况下，二级结构测定，三级结构测定通常分别用什么方法，或者结合使用测定，另外对于酶的结构分析以及催化位点，活性位点什么的分析还需要做哪些工作呢，请教下达人，谢谢了
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1楼 2011-12-14 11:43:40
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半步一生

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
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西瓜(金币+3): 鼓励交流！ 2011-12-31 22:11:05
qwky2010(金币+5): 感谢分享 2012-01-01 10:04:59
我知道几个二级结构和三级结构预测网站，
Phyre，Swiss这两个在线分析网站，对于新手来说用用不错，同源数据库蛮全的。
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9楼2011-12-31 16:52:55
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hewensen

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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wanhscn(金币+2): 鼓励交流！GOOD! 2011-12-14 12:40:20
貌似这个问题应该很难的，我也很想知道答案呢，有的酶的结构可以在网上查到的，楼主不妨试试蛋白数据库http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
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2楼2011-12-14 12:25:13
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lindasunhui

金虫 (小有名气)
★ ★
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西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-12-14 19:47:42
二级结构用SELCON3程序解析，三级结构我也不知道。
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3楼2011-12-14 13:07:21
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imyting

至尊木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
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qwky2010(金币+15): 真诚谢谢了啊 2011-12-14 15:36:12
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good！ 2011-12-14 19:47:22
二级结构的含量可以用圆二色谱法进行测定，三级结构如果PDB数据库中没有的话，可以用两种办法获得：1.使用计算机软件进行同源模建，以及通过动力学进行精制；2.通过实验方法获得晶体，好像上海那边可以解析晶体结构。不过第二种方法比较难，养晶本身就是个概率事件。至于酶的结构分析以及催化位点，活性位点的分析，再得到三级结构之后可以通过计算机软件进行对接，再分析受体交联作用来分析。一般情况下只要三级结构没太大的问题，结构都是比较准确的。
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qwky2010
5楼2011-12-14 13:21:26
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