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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS2.5中CDOCKER模块对接的问题
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] DS2.5中CDOCKER模块对接的问题 已有1人参与

最近在使用DS2.5进行分子对接的时候出现过这样的问题。对接结果为0 poses，提示的错误信息为：No refined poses found for ligand ****.也曾询问过原因，说是对接球的位置和半径不正确，可以尝试着改变对接球的中心坐标和球半径来解决。可是试了很多回，没有一次是可以成功对接出结果的。想请教各位对接高手，对于这个问题，有没有别的解决方法？或者说可否考虑试用AutoDock4.0来进行对接？多谢各位。
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努力的生活着
1楼 2011-12-12 15:18:48
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snoobic

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我也是一样啊，不知道怎么回事
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3楼2011-12-13 01:54:39
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L_tr

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm(金币+2): 谢谢交流~ 2011-12-12 20:30:16
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-12 22:28:25
wangyan10(金币+1): 2011-12-13 08:01:34
wangyan10(金币+1): ★★★很有帮助 谢谢 2012-01-04 16:07:03
貌似是半径太小，你所选的分子根本无法放入球中，可以调大半径试一试。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-12-12 19:43:37
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waley89

禁虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-29 16:24:54
本帖内容被屏蔽
4楼2014-03-29 15:33:59
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