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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 关于使用Dmol3进行过渡态搜索的问题！
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digghost

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by amition at 2012-09-29 15:17:07
我又有点糊涂了。过渡态不是通过反应物和生成物来确定的吗？ 我先优化了反应物，不优化生成物吗？ 直接生成过渡态？ 最后优化生成物？ 也就是说在进行过渡态搜索时生成物的结构还不是确定的？...

对于小分子可以这样做，因为并不涉及到与未参加反应的的原子的相互互作用，因此原子的弛豫时间非常短，但是对于固相来说，所需要的弛豫时间有可能是很大的，可能你的反应物都生成了，你系统还没弛豫完。因此在固相扩散中经常会出现，扩散激活能要大于tst给出的能量。对于你这种表面反应我也不太清楚，催化剂表面原子的弛豫时间，和你的反应速率常数是什么关系，你可以看看相关的催化动力学理论，或用分子动力学跑一下
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呵呵了
11楼2012-09-29 16:27:41
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vasp001

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你这个还是SCF不收敛造成的，解决办法：（1）将 DMol3 Caculation－Electronic对话框中的Ma. SCF Cycles调整到200；（2）加上Use Smearing。如果这两项还不行，说明你的模型有问题，请先把反应物和产物的模型结构优化了在进行TS Search
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一定要精通MaterialsStudios,VASP.
12楼2013-05-08 22:55:49
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博致远

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也遇到了相同的问题，你的问题解决了吗，求回复
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13楼2015-10-19 09:22:23
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博致远

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by vasp001 at 2013-05-08 22:55:49
你这个还是SCF不收敛造成的，解决办法：（1）将 DMol3 Caculation－Electronic对话框中的Ma. SCF Cycles调整到200；（2）加上Use Smearing。如果这两项还不行，说明你的模型有问题，请先把反应物和产物的模型结构优 ...

我已经进行了优化，而且并没有达到SCF的最大圈数，在中间的时候就失败了，这是什么原因呀？
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14楼2015-10-19 09:24:14
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雨梦的星空

木虫 (小有名气)
楼主，现在这个问题解决了吗？能分享一下你的经验吗？我最近也被这个问题困扰了。
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tobeabetterme.
15楼2016-06-07 09:31:53
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清华粉体

金虫 (小有名气)
前辈您问题解决没啊？
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16楼2016-09-28 10:29:56
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求MS大神

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sdsdlgh at 2011-12-19 20:55:40
同期待啊，我有相同问题，lz解决了吗？

请问你当初是怎么解决的
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17楼2019-03-14 14:28:03
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

【答案】应助回帖

Unable to bracket maximum from both endpoints，LST/QST的过程是先要在假定的LST路径（通常是在反应物和生成物坐标线性插值得到的路径）上找到极大点，找不到的话程序就会跳出错误。按照现在跑出来的结果看，LZ的反应物可能做得有点问题，比生成物高出十几eV，这个并不合理，构型可能没做过优化或者结构本身优化的时候产生了什么问题，但暂时很难判断了。

传统的找过渡态过程本身是需要技巧和化学直觉的，并不是随便扔上两个结构建立个path程序就能够自动找出来。现在虽然是有构象搜索的特定算法，不过限制也诸多。

至于找过渡态，其实可以细化成过渡态搜索和过渡态精修两个部分，在能够猜测得到过渡态的大致样子的情况其实可以直接构造模型进行约束优化算partial Hessian，然后直接进行TS opt，TS search不是必要的，当然这是需要足够的经验和技巧的。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
18楼2019-04-02 02:52:46
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wmmnvli

禁虫
本帖内容被屏蔽
19楼2022-04-04 15:47:05
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