| 查看: 6072 | 回复: 18 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
关于使用Dmol3进行过渡态搜索的问题！ 已有2人参与
|
||
|
本人新手 刚接触Dmol3不久 目前正在做吸附过渡态的搜索，有几个问题想请教大家： 1、对于吸附态轨迹文件的生成，我是把吸附前和吸附后的结构分别进行优化，然后分别做为反应物和生成物进行原子match，生成轨迹文件。但是我发现有一次有一种吸附结构居然不能生成轨迹文件 好像说反应物和生成物的晶体参数不一致。为什么会出现这种情况呢？还有我经常要手动进行一些原子match，正常吗？ 2、对于轨迹文件进行过渡态的搜索后，出现错误 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 这个问题我在论坛上搜索过，挺多的 但是回答的大部分是反应物和生成物的结构不对 需要调整。可是我的反应物和生成物都是优化过的，应该是稳定的还怎么进行调整呢？？ 3、关于反应物和生成物的优化，我好像看过有人说过渡态搜索时一些参数设置最好和优化时的一样，是这样吗？如果我对他们都用Castep进行优化，然后再到Dmol3进行TS搜索可以吗？如果想较容易的搜索出过渡态那么参数应该如何设置比较好呢？ 最后还是关于这个问题 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 是不是在参数设置上有什么问题呢？ 希望大家可以指点一下啊！~ 不胜感激~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
招博士
已经有4人回复
-
救命帖
已经有7人回复
-
限项规定
已经有6人回复
-
西南交通大学国家级人才团队2026年博士研究生招生（考核制）—机械、材料、力学方向
已经有3人回复
-
英文综述是否需要润色及查重
已经有5人回复
-
为什么nbs上溴 没有产物点出现呢
已经有9人回复
-
最失望的一年
已经有18人回复
雨梦的星空
木虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1556.7
- 散金: 10
- 红花: 3
- 帖子: 101
- 在线: 209.4小时
- 虫号: 3314085
- 注册: 2014-07-08
- 性别: GG
- 专业: 金属结构材料
15楼2016-06-07 09:31:53
2楼2011-12-12 12:04:57
3楼2011-12-14 15:59:24
4楼2011-12-14 20:53:57