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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » VMD distance distribution 脚本中的一个问题
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xiaoyingw

金虫 (小有名气)

[求助] VMD distance distribution 脚本中的一个问题

我在Using VMD 中看到有个distance distribution 脚本的例子，里面提到
set dr [expr ($r_max - $r_min) /($N_d - 1)]
for {set k 0} {$k < $N_d} {incr k} {
set distribution($k) 0
}
N_d is the number of bins for the distribution
请问有没有人知道N_d 是什么，怎么给它赋值呀？
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向前冲！！！
1楼 2011-12-12 11:41:52
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
chaizhm(金币+3): 谢谢~ 2011-12-12 13:58:27
"N_d is the number of bins for the distribution"
你的帖子里就有这个的说明啊。
按字面意思，应该是 层数
按我的理解，比如 N_d 要赋值为100
则： set N_d 100
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2楼2011-12-12 12:42:03
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xiaoyingw

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2011-12-12 12:42:03:
"N_d is the number of bins for the distribution"
你的帖子里就有这个的说明啊。
按字面意思，应该是 层数
按我的理解，比如 N_d 要赋值为100
则： set N_d 100

谢谢回复呀！不过我还是不明白这句话的意思，为什么是100呢？
我把它改成100以后就是这个错误：
missing operator at _@_
in expression "1.221885386686643 + 0 _@_0.054246180194147564"
这个要怎么弄呢？
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向前冲！！！
3楼2011-12-12 14:08:42
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoyingw at 2011-12-12 14:08:42:
谢谢回复呀！不过我还是不明白这句话的意思，为什么是100呢？
我把它改成100以后就是这个错误：
missing operator at _@_
in expression "1.221885386686643 + 0 _@_0.054246180194147564"
这个要 ...

我说的是 “比如”
你需要学习一下 TCL 脚本的简单使用，就知道怎么解决这个问题了。

PS ：
以后出现问题，需要讨论的时候，尽量把问题说全面，说清楚。
我回复的   “比如 N_d 要赋值为100
则： set N_d 100 ”

是想说明 “怎么给它赋值呀？”的问题，在你的脚本中，N_d 具体取多少，需要依据你的具体问题而定。
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4楼2011-12-12 15:56:08
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xiaoyingw

金虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2011-12-12 15:56:08:
我说的是 “比如”
你需要学习一下 TCL 脚本的简单使用，就知道怎么解决这个问题了。

PS ：
以后出现问题，需要讨论的时候，尽量把问题说全面，说清楚。
我回复的   “比如 N_d 要赋值为100
则： set N_d ...

那这个错误是什么原因呢？你就直接告诉我吧
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向前冲！！！
5楼2011-12-13 08:56:07
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