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计算Cl-在Fe表面吸附问题时体系加电荷方法
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计算Cl-离子在Fe表面吸附时，我的算法是对cl原子加一个负电荷后，对整个体系赋予-1价，几何优化、能量计算后、结果计算出的吸附能为正值。 想请大侠们帮忙解决一下，这是哪方面的问题，会导致最后的吸附能为正值。 |
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acridine
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
uuv2010(金币+2): 多谢指导！ 2011-12-15 23:49:57
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uuv2010(金币+2): 多谢指导！ 2011-12-15 23:49:57
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首先说，MS是个大杂烩，虽然很方便但也容易出现误会。比如你们讨论的这个设置原子电荷的功能，并不一定是针对dmol或castep模块的设置。所以在使用这些设置之前，一定要看好帮助文件中的介绍。 另外关于体系中的离子，其实第一原理就是寻找体系基态的过程，至于体系中的到底是离子还是原子，则需要看计算出来的电子得失情况。带电体系也是一样，就比如楼主的离子，cl原子吸附到Fe，你对体系加了一个电子，那么软件就会自动寻找这个电子最稳定分布。有可能是分布在cl原子上，使之成为离子。亦有可能是分布到Fe-slab上。究竟是那种情况，自然是要听从软件的计算结果。 限制这个电子停留在Cl上，我不知道意义何在，因为在实际的实验中你也不能保证这个电子始终停留在Cl上而没有转移到别处吧～ |
14楼2011-12-15 23:34:45
hakuna
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18楼2012-02-21 07:16:25
acridine
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acridine
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sunyang1988(金币+3): 谢谢指点 2011-12-11 09:26:08
sunyang1988(金币+3): 谢谢指点 2011-12-11 09:26:08
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第一个，关于公式，最好能有相关的参考文献对比。因为比较带电体系能量的时候需要进行能级的alignment，以使得能量具有可比性。这个过程在计算带电缺陷形成能的时候经常出现，不知道研究带电吸附的时候有没有类似的过程，找下相关文章吧。 第二个问题。首先，因为有些时侯离子是一种比较化学的、定性的描述，而实际体系中并不一定是这样的带电原子形式存在的。所以要先明确你模拟的体系是否真的是这种带负电的Cl原子参与。 另外就是模型的意义和合理性。我们想要模拟的是无限固体Fe表面的吸附，但由于计算的限制，我们只能建立吸附位置附近的结构模型。如果此时如果你让模型带电，那么其实模拟的是：电荷局域在吸附位置附近的情况。而实际上，即使真的有额外电荷引入，可能也不会局限在吸附位置附近，尤其这里的Fe还是导体。那么你的模型的合理性就有待商榷了。 以上只是我的看法了，我也没有具体研究过吸附，只当做建议就好了。  |
4楼2011-12-11 00:48:00
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