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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 这是怎么回事？
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gyldmy

铜虫 (小有名气)

[求助] 这是怎么回事？

如图：为什么HOMO和LUMO会出现在没有分子的地方？
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1楼 2011-12-06 22:48:58
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acridine

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyldmy(金币+2): 2011-12-07 08:26:36
sunyang1988(金币+2): 谢谢指点 2011-12-07 10:52:10
gyldmy(金币+8): 2011-12-07 20:07:29
gyldmy: 回帖置顶 2011-12-07 20:17:18
不稀奇。MS中结构文件是xsd,但诸如电子密度之类的数据文件是另外存储于.grd文件中的。
分析时，软件把grd数据导入到xsd界面中画图。
但如果改动了xsd文件中的结构，再次分析的时候，grd文件中数据就会和原子位置对应不上。
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2楼2011-12-06 23:20:32
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by acridine at 2011-12-06 23:20:32:
不稀奇。MS中结构文件是xsd,但诸如电子密度之类的数据文件是另外存储于.grd文件中的。
分析时，软件把grd数据导入到xsd界面中画图。
但如果改动了xsd文件中的结构，再次分析的时候，grd文件中数据就会和原子位置 ...

但是我并没有改变xsd文件
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3楼2011-12-07 08:27:39
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acridine

木虫 (正式写手)
★
fzx2008(金币+1): 谢谢指教 2011-12-07 19:15:10
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyldmy at 2011-12-07 08:27:39:
但是我并没有改变xsd文件

这个可能是无意间改动的，你可以看下两个文件的修改时间，如果没有改动，两个文件最后的修改时间应该是相同的。
不过选择: 分析 －> update structure 应该就能解决问题了。
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4楼2011-12-07 16:43:03
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by acridine at 2011-12-07 16:43:03:
这个可能是无意间改动的，你可以看下两个文件的修改时间，如果没有改动，两个文件最后的修改时间应该是相同的。
不过选择: 分析 －> update structure 应该就能解决问题了。

是这样的，我看了两个文件的属性，时间确实不一样，怎么update structure呢？我没有看见这个选项啊？能具体点吗？谢谢
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5楼2011-12-07 20:04:42
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by acridine at 2011-12-07 16:43:03:
这个可能是无意间改动的，你可以看下两个文件的修改时间，如果没有改动，两个文件最后的修改时间应该是相同的。
不过选择: 分析 －> update structure 应该就能解决问题了。

呵呵，不用了，问题解决了，非常感谢！
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6楼2011-12-07 20:07:18
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gyldmy at 2011-12-07 20:07:18:
呵呵，不用了，问题解决了，非常感谢！

那是什么问题呢？可否与大家分享一下？
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-12-07 22:26:08
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-12-07 22:26:08:
那是什么问题呢？可否与大家分享一下？

就是用acridine的方法解决的，问题应该是MS计算之后，XSD文件中的轨迹信息没有及时的更新，手动更新一下就ok了！分析 －> update structure
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8楼2012-01-03 21:15:31
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