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Illusionist银虫 (正式写手)
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如何Scan两分子距离引起的能量差
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如何Scan两分子距离引起的能量差 看了半天说明书，只看到二面角，键长什么的scan，是否可以scan两分子的距离。 我要算的是两平面分子，scan他们面对面的距离。 求租。 |
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lion0528
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【答案】应助回帖
Illusionist(金币+5): 感激不尽 2011-12-06 10:28:14
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这是苯与氪之间的能量扫描 %chk=benzenen_kr %mem=7500MB %nprocshared=4 #p scan wb97xd/cc-pvdz scf=tight benzenen_kr 0 1 C -1.230622000 0.710500000 0.000000000 C 0.000000000 1.421000000 0.000000000 C 1.230622000 0.710500000 0.000000000 C 1.230622000 -0.710500000 0.000000000 C 0.000000000 -1.421000000 0.000000000 C -1.230622000 -0.710500000 0.000000000 H 0.000000000 2.491000000 0.000000000 H -2.157269000 1.245500000 0.000000000 H -2.157269000 -1.245500000 0.000000000 H 0.000000000 -2.491000000 0.000000000 H 2.157269000 -1.245500000 0.000000000 H 2.157269000 1.245500000 0.000000000 x 0.000000000 0.000000000 0.000000000 Kr 13 R 5 90. 1 90. R 3.4 8 0.05 固定苯不动，X为虚原子，不影响体系能量。 Kr 13 R 5 90. 1 90.这一项描述的是KR与苯环的位置关系，与13号原子X的距离R,与5号原子的二面角为90度（一定要写点），与1号原子的二面角为90.这些吗，描述能够保证KR与苯环是垂直的 R 3.4 8 0.05 表示KR与苯环的初识距离为3.4，一工扫描8个点，每个点走0.05步，即 3.4 3.45 3.5 3.55 。。。每个点有相应的能量 |
4楼2011-12-06 09:55:25
beefly
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2楼2011-12-05 21:15:14
Illusionist
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3楼2011-12-06 08:39:03
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5楼2011-12-06 11:46:35
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