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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】求助 scan 的能量计算
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杨瑞09

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助 scan 的能量计算

%nproc=2

# B3LYP/6-31G(d) Opt=ModRedundant nosymm  

test scan

2,1
   6   -0.208    1.268    0.001
   7   -0.707   -0.034    0.001
   6    1.195    1.147    0.001
   7    1.558   -0.200    0.001
   6    0.400   -0.893    0.001
   1   -0.853    2.143    0.001
   1    1.943    1.938    0.002
   1    0.304   -1.983    0.001
   1   -2.000   -2.000   -0.000

1 F
2 F
3 F
4 F
5 F
9 F

--Link1--
%nproc=2

# B3LYP/6-31G(d) Opt=ModRedundant nosymm  

test scan

2,1
   6   -0.208    1.268   0.001
   7   -0.707   -0.034   0.001
   6    1.195    1.147   0.001
   7    1.558   -0.200   0.001
   6    0.400   -0.893   0.001
   1   -0.853    2.143   0.001
   1    1.943    1.938   0.002
   1    0.304   -1.983   0.001
   1   -2.000   -1.800  -0.000

1 F
2 F
3 F
4 F
5 F
9 F
输入了2个任务，可结果只给出了第一个的能量，希望给位大侠给予帮助，小虫十分着急！！！

[ Last edited by 杨瑞09 on 2011-1-7 at 13:10 ]
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1楼 2011-01-07 13:03:53
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manson1998

金虫 (著名写手)
杨瑞09(金币+3):谢谢 2011-01-07 13:45:25
分开输入呗
另外你这个是scan么？
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2楼2011-01-07 13:36:25
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2011-01-07 13:36:25:
分开输入呗
另外你这个是scan么？

我要算440个累死呢，就是算能量，找到最低点，分开算不太可能。我就是想算几个就出几个能量。
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3楼2011-01-07 13:42:45
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manson1998

金虫 (著名写手)
不明白 你是手动改坐标吗？ 为什么不用scan呢？
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4楼2011-01-07 13:54:50
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2011-01-07 13:54:50:
不明白 你是手动改坐标吗？ 为什么不用scan呢？

是手动改坐标，这么算不出来吗？只要能量作图
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5楼2011-01-07 13:59:50
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
杨瑞09(金币+2):O(∩_∩)O谢谢 2011-01-07 16:01:46
我也不明白楼主的意思 如果要做PES直接做柔性扫描设置相应的变量步数 步长就好了啊
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6楼2011-01-07 14:14:13
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manson1998

金虫 (著名写手)
杨瑞09(金币+3):O(∩_∩)O谢谢参与 2011-01-07 16:01:24
引用回帖:
Originally posted by 杨瑞09 at 2011-01-07 13:59:50:

是手动改坐标，这么算不出来吗？只要能量作图

那你何苦输入440个结构呢？用scan啊，手册上有
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7楼2011-01-07 14:47:55
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杨瑞09

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2011-01-07 14:47:55:


那你何苦输入440个结构呢？用scan啊，手册上有

是老板也不知道从哪儿弄得这个输入文件，让算，还想让输出440个能量来作图。。。
有点像跟踪反应路径
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8楼2011-01-07 16:00:46
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yongma2008

木虫 (著名写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流！ 2011-01-07 18:26:26
杨瑞09(金币+2):O(∩_∩)O谢谢 2011-01-08 09:55:21
=======================================
#p opt=modredundant  b3lyp/6-31g(d,p) nosymm

scan

-1 1
C                 -0.00475200    0.01000100   -0.96295500
H                 -0.01810900    1.06004400   -1.23133500
H                 -0.91745900   -0.48100900   -1.28027500
H                  0.86635900   -0.48499500   -1.37707700
Cl                 0.10017300   -0.10877800    0.90559200
Br                -0.24969100    0.21928700   -4.10391700

B 6 1 S 13 -0.1
=======================================
两行等号中间是一个简单的scan例子，可以根据这个例子引申，最后一行S就是scan,13是扫描次数，-0.1就是扫描步长。
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9楼2011-01-07 16:42:00
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xj544

木虫 (小有名气)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流！ 2011-01-07 18:26:21
杨瑞09(金币+1):O(∩_∩)O谢谢 2011-01-08 09:55:48
楼主，我发现你的两个坐标只有第九个原子的Y坐标不同，你是不是要改变一系列的Y值，得到一系列的能量？
如果是这样，你可以扫描坐标，比如要扫描9号原子，Y值从-2.0开始扫描，扫到-1.0，扫描5步，步长为0.2，可以这样写：
X 9 -2.0 -1.0 0.0 s 5 0.2
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10楼2011-01-07 16:54:01
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狼外婆

金虫 (著名写手)
楼上正解，你老板不懂。
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11楼2011-01-07 22:51:47
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