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生物生物

新虫 (初入文坛)

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10楼: Originally posted by 夜舞龙 at 2011-12-01 21:09:16
楼上的都正解,高保真酶扩增是没有A的,不能T-A克隆。建议换平末端载体,可以直接克隆,比加A效果要好。比如用iInvitrogen平末端载体,或者国产的全式金平末端载体,我都用过,还是不错的。

做TA克隆时,直接用PCR产物跟pMD18载体连接,我的PCR产物结果较好,目标片段长度263bp,电泳时看不出非特异扩增,有引物二聚体。
1ul载体,4ulpcr产物,5ul自带的solutionI混合,16度连接过夜,42度热激45秒,冰上2分钟导入感受态DH5a摇床培养1小时后,在含X-gal,IPTG,Amp的LB固体培养基平板筛选,看不到蓝白班,但有许多单菌落,挑单菌落于含1ml LB液体培养基的试管中摇菌10小时,用菌液PCR检测(所用引物于前面pcr的引物相同,反映条件也相同,只是94度预变性时间改为10分钟)。但是检测结果没有目的条带,只有100bp左右的引物二聚体。
想问问您,这是什么原因?
21楼2013-03-27 13:36:27
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piaoyunokok

木虫 (正式写手)


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18楼: Originally posted by 生物生物 at 2013-03-27 13:35:26
做TA克隆时,直接用PCR产物跟pMD18载体连接,我的PCR产物结果较好,目标片段长度263bp,电泳时看不出非特异扩增,有引物二聚体。
1ul载体,4ulpcr产物,5ul自带的solutionI混合,16度连接过夜,42度热激45秒,冰上 ...

首先,还是你的PCR产物是没有A尾巴的,直接连T载体本来就很困难的。
2、PCR产物与T载体的比例也很重要,你可以多试几个梯度,注意是摩尔比
3、转化时,加入连接产物后是要先冰浴30Min的,然后再热击。
4、确保你的抗生素有效,这个你需要做一个对照的。
  此外,你的感受态以及载体是否也有效?
22楼2013-03-27 15:18:29
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生物生物

新虫 (初入文坛)


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22楼: Originally posted by piaoyunokok at 2013-03-27 15:18:29
首先,还是你的PCR产物是没有A尾巴的,直接连T载体本来就很困难的。
2、PCR产物与T载体的比例也很重要,你可以多试几个梯度,注意是摩尔比
3、转化时,加入连接产物后是要先冰浴30Min的,然后再热击。
4、确保你 ...

谢谢你的建议,我用的是taq酶,有A尾巴;PCR产物与T载体的比例是个问题;加入连接产物后是要先冰浴30Min这步我也做了,Amp,感受态与载体都是新买的,倒是没验证是否有问题。
23楼2013-03-27 21:04:59
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夜舞龙

至尊木虫 (知名作家)


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21楼: Originally posted by 生物生物 at 2013-03-27 13:36:27
做TA克隆时,直接用PCR产物跟pMD18载体连接,我的PCR产物结果较好,目标片段长度263bp,电泳时看不出非特异扩增,有引物二聚体。
1ul载体,4ulpcr产物,5ul自带的solutionI混合,16度连接过夜,42度热激45秒,冰上 ...

应该是目的片段没有连上。你用的是PCR产物直接连接的,建议切胶回收纯化目的片段后,重新连接试一试。
24楼2013-03-28 00:02:23
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vickie20

铜虫 (小有名气)


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如果PCR产物尾巴是加A的,那就纯化之后再做连接,用乙醇沉淀法就挺好的,回收率感觉比试剂盒高多了,用PCR产物直接跟载体连接,恐怕是对连接酶有影响,所以没连上。
25楼2013-03-28 23:02:26
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冰风颤木

金虫 (正式写手)


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9楼: Originally posted by wickhamhan at 2011-12-01 19:42:39
平末端DNA片段加A方法
先对平末端PCR产物纯化后,浓度要求至少20ng/ ul(大概就好,跑胶图像条带清晰,明亮),取14.5 ul PCR产物,加入2 ul Taq Buffer,3ul dNTP,0.5 ul Taq酶,在72度反应10~20min后直接回收纯 ...

加A反应不是:
纯化PCR产物:7 ul
Taq缓冲液1 ul
2mmol/LdATP 1 ul
Taq酶 1 ul吗
我在书上看的 没有做过实验 准备做这个 您看对吗
船到桥头自然直
26楼2013-06-21 17:26:41
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a984444204

金虫 (初入文坛)


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17楼: Originally posted by sarah-miao at 2012-11-28 15:11:45
楼上都是正解,一般高保真酶是不加ployA的,所以肯定连不上T载体了哈,先加上A,再连,还是很好练的,或者你可以考虑直接用LA,因为那个也是扩出来有A的

楼主,你这个情况最后怎么解决的。
失败是家常,。。。。
27楼2014-03-05 16:01:57
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