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mmlzhang

铁虫 (初入文坛)

[求助] 基因的定位与标记设置

大家好
  我手里有个水稻突变体,目前将基因定位到130Kb的物理距离内,下载这130Kb的基因序列去NCBI里BLAST设置30来对INDEL等标记筛选标记时,亲本一能扩出来而且很亮,亲本二(突变体)扩不出来或者扩出来很弱的带,只有少数几对引物两亲本都能扩出来而且没多态,我的是籼梗交的,突变体是T-DNA库里获得的,请问为什么多态这么差,是不是这130Kb范围内序列很乱,含有T-DNA序列,请各位指导指导!!!!
心有多宽,路就有多宽
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sunwei57

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

130Kb大概就10个基因左右,你可以根据表型估计基因了,再做精细定位代价太大,
2楼2012-03-16 21:50:17
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