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mmlzhang

铁虫 (初入文坛)

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[求助] 基因的定位与标记设置

大家好
我手里有个水稻突变体，目前将基因定位到130Kb的物理距离内，下载这130Kb的基因序列去NCBI里BLAST设置30来对INDEL等标记筛选标记时，亲本一能扩出来而且很亮，亲本二（突变体）扩不出来或者扩出来很弱的带，只有少数几对引物两亲本都能扩出来而且没多态，我的是籼梗交的，突变体是T-DNA库里获得的，请问为什么多态这么差，是不是这130Kb范围内序列很乱，含有T-DNA序列，请各位指导指导！！！！

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心有多宽，路就有多宽

1楼 2011-12-01 11:09:11

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sunwei57

木虫 (小有名气)

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注册: 2012-03-16
专业: 基因表达调控与表观遗传学

【答案】应助回帖

130Kb大概就10个基因左右,你可以根据表型估计基因了,再做精细定位代价太大,

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2楼2012-03-16 21:50:17

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