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do_dssp 使用求助
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我先从 ftp://ftp.cmbi.ru.nl/pub/software/dssp/ 下载了linux 版本的dssp 解压缩到目录/home/jiaobao/ruanjian/dssp/ 之后重新命名为dssp 然后使用 export DSSP=/home/jiaobao/ruanjian/dssp/dssp 这一步根据http://www.gromacs.org/Documentation/Gromacs_Utilities/do_dssp 可是我在使用的时候，出现错误： Fatal error: DSSP executable (/usr/local/bin/dssp) does not exist (use setenv DSSP) For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors ------------------------------------------------------- 有时候是 Fatal error: Failed to execute command: /usr/local/bin/dssp -na dduh3nVZ ddgIvCrU > /dev/null 2> /dev/null For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors ------------------------------------------------------- 纠结了很久还是没有搞定，哪位前辈用过这个？ 请多指教！ 非常感谢！ [ Last edited by jiaoyixiong on 2011-11-29 at 11:15 ] |
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5楼2013-10-14 19:19:31
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我的usr/local/bin里面已经有dssp了，但是运用do_dssp这个命令的时候也出现了以下问题 Fatal error: Failed to execute command: /usr/local/bin/dssp -na dduh3nVZ ddgIvCrU > /dev/null 2> /dev/null For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors 请教楼主是否已经解决及时如何解决的？谢谢 |
2楼2013-10-14 15:46:51
3楼2013-10-14 16:06:33
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4楼2013-10-14 17:56:55
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