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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » do_dssp 使用求助
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转基因猴子

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 紫漠残星 at 2013-10-18 10:48:03
和linux一样，要在文件所在目录输入命令，在win7系统文件所在目录下摁住shift，点右键可以打开当前目录的命令窗口，...

好的，我试试，谢谢

[ 发自小木虫客户端 ]
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我还年轻，我要上路！
11楼2013-10-19 08:09:49
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japmail

银虫 (小有名气)
哎，问题一样，路径设置的问题，估计跟gromacs中demo一样，不过我也没弄好呢，坐等大神指点啊
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一个高尚而又纯粹的爷
12楼2014-10-23 21:18:41
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blacksep

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-10-14 16:06:33
这是计算蛋白质的二级结构的工具， 这个 do_dssp 也没有使用成功。我后来我找了一个可执行文件直接生成用的：

dssp.exe -i sp_c.pdb -o sp_c.dssp...

你好，我用的也是window下的gromas，我想请问dssp的组件应该放在哪个目录里面呢？   原文里面这个地方“/home/jiaobao/ruanjian/dssp/”，指的是哪个文件夹呢？谢谢你。。。我在网上找了好久都没弄清楚这个地方..
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13楼2018-10-18 08:31:06
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