应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 同源模建
51/1返回列表
查看: 1310  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] 同源模建

目前有一个蛋白质，刚被发表晶体结构，有pdb文件了，但是sybyl数据库里没有。
这个pdb文件里有3个一样的蛋白分子，怎么样能分离出来单个的蛋白质pdb文件啊，另外，怎么用已有的pdb做模板同源模建的
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2011-11-28 10:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tudoudigua

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 王家大成 at 2011-11-29 20:14:15:
Swissmodel可以同源建模，但是同源性至少不低于30％

能具体说一下同源模建的基本原理吗
这是考试题
非常感谢！
赞一下 回复此楼
人生总是在习惯那些不习惯的习惯！
6楼2011-12-23 10:10:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

超人与小木虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-28 11:59:07
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:33:28
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:12
DS就可以做，还有很多在线的网站都可以，如Swissmodel等等
赞一下(3人) 回复此楼
超人不会飞
2楼2011-11-28 10:51:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cpuzzx

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 谢谢~ 2011-11-28 14:46:11
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:33:38
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:25
你可以用UltraEdit软件分离出单个pdb文件，用DS或者MOE都可以同源建模的
赞一下(3人) 回复此楼
3楼2011-11-28 12:25:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qustwq

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 谢谢~ 2011-11-28 18:20:55
lmzxcom1(金币+5): 2011-11-29 09:01:13
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:34:04
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:41
首先下载下那个PDB来，然后在sybyl中将不需要的蛋白删除将剩余部分另存为新的PDB文件就可以了！
赞一下(3人) 回复此楼
4楼2011-11-28 14:51:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +6 zju2000 2026-08-16 6/300 2026-08-17 10:01 by xter9665
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +10 Ldrop2023 2026-08-13 10/500 2026-08-17 09:59 by 小豌豆_发芽
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 3/150 2026-08-17 09:49 by xLVPIRuSvCUe
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭