应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 同源模建
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 1185  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] 同源模建

目前有一个蛋白质，刚被发表晶体结构，有pdb文件了，但是sybyl数据库里没有。
这个pdb文件里有3个一样的蛋白分子，怎么样能分离出来单个的蛋白质pdb文件啊，另外，怎么用已有的pdb做模板同源模建的
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2011-11-28 10:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

超人与小木虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-28 11:59:07
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:33:28
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:12
DS就可以做，还有很多在线的网站都可以，如Swissmodel等等
赞一下(3人) 回复此楼
超人不会飞
2楼2011-11-28 10:51:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cpuzzx

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 谢谢~ 2011-11-28 14:46:11
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:33:38
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:25
你可以用UltraEdit软件分离出单个pdb文件，用DS或者MOE都可以同源建模的
赞一下(3人) 回复此楼
3楼2011-11-28 12:25:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qustwq

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 谢谢~ 2011-11-28 18:20:55
lmzxcom1(金币+5): 2011-11-29 09:01:13
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-11-29 20:34:04
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-23 13:50:41
首先下载下那个PDB来，然后在sybyl中将不需要的蛋白删除将剩余部分另存为新的PDB文件就可以了！
赞一下(3人) 回复此楼
4楼2011-11-28 14:51:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王家大成

木虫 (正式写手)

囧囧小虫
★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-29 20:33:55
Swissmodel可以同源建模，但是同源性至少不低于30％
赞一下(1人) 回复此楼
一念起，万水千山；一念灭，沧海桑田！
5楼2011-11-29 20:14:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tudoudigua

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 王家大成 at 2011-11-29 20:14:15:
Swissmodel可以同源建模，但是同源性至少不低于30％

能具体说一下同源模建的基本原理吗
这是考试题
非常感谢！
赞一下 回复此楼
人生总是在习惯那些不习惯的习惯！
6楼2011-12-23 10:10:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lmzxcom1 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 329求调剂 +7 钮恩雪 2026-03-25 7/350 2026-03-27 04:28 by wxiongid
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 311求调剂 +5 lin0039 2026-03-26 5/250 2026-03-26 22:43 by 学员8dgXkO
[考研] 294分080500材料科学与工程求调剂 +4 柳溪边 2026-03-26 4/200 2026-03-26 21:14 by XPU李庆
[考研] 321求调剂 +5 材料cailiao 2026-03-21 5/250 2026-03-26 20:41 by fmesaito
[考研] 07化学280分求调剂 +8 722865 2026-03-23 8/400 2026-03-26 20:00 by 不吃魚的貓
[考研] 生物学学硕，一志愿湖南大学，初试成绩338 +4 YYYYYNNNNN 2026-03-26 4/200 2026-03-26 19:00 by macy2011
[考研] 299求调剂 +7 某某某某位 2026-03-21 8/400 2026-03-25 20:34 by 热情沙漠
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 材料学硕，求调剂 6+4 糖葫芦888ll 2026-03-22 9/450 2026-03-25 11:19 by greychen00
[考研] 材料学求调剂 +6 Stella_Yao 2026-03-20 6/300 2026-03-25 00:37 by baoball
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 315分，诚求调剂，材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭