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[交流]
vasp怎样快速正确写出一个结构的POSCAR???
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| 如题,在用vasp时遇到最头疼的问题就是如何正确快速写出一个结构(特别是多原子体系)的POSCAR,请各位大侠交流经验,并恳请群主加精! |
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-11-25 13:25:41
倔强的坚果墙: 回帖置顶 2011-12-17 11:14:19
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-11-25 13:25:41
倔强的坚果墙: 回帖置顶 2011-12-17 11:14:19
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MS(material studio) 下面是具体建模步骤 #################### 前几天回帖说过自己产生POSCAR文件是通过CASTEP完成的,具体过程如下: 1. 在CASTEP中把模型建好。 2. 模块中的CASTEP,计算,单击“Run”旁边的“Files...”按钮,然后点击“Save Files”按钮,弹出对话框,选“No”,将相关文件保存到project中,会出现类似计算出现的下一级文件夹。 3. 从电脑中找到此文件夹,找到***.cell文件。此文件为隐藏文件,***为MS中模型的名字。有用的为前几行,以BCC-Fe单胞为例,产生的Fe.cell文件开头内容如下: %BLOCK LATTICE_CART 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 %ENDBLOCK LATTICE_CART %BLOCK POSITIONS_FRAC Fe 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 Fe 0.5000000000000000 0.5000000000000001 0.5000000000000001 %ENDBLOCK POSITIONS_FRAC ...... 4. 书写POSCAR文件。 第一行,自定义体系名,随便自己写了,以自己方便为好 第2-5行为晶格缩放因子(晶格常数)和晶格矢量,可以有两种写法 第一种: 1.0000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 第二种: 2.866400001.0000 1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 1.000000000000000 推荐第二种写法 第6行,原子数目。应该按照种类分别写,后面坐标以及POTCAR中的顺序应与此处相同。 第7行,给出的坐标类型。“cartesian”和“direct”之分,分别是笛卡尔坐标和分数坐标,通常用第2中,分数坐标。 第8行及其以后,按照第6行原子种类排序的各个原子的分数坐标。 注:如果要考虑,部分坐标驰豫的话,需要在第7行前加入一行,“Selective dynamics”,并在各个原子坐标后,以“T”,“F”标记那个坐标需要驰豫 BCC-Fe产生POSCAR如下,具体书写格式可参考VASP Guide BCC-Fe 2.866400000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000 2 Direct 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000 本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1376166 |
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