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晶体 气相 液相的问题
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| 各位大虾，本人在进行卟啉分子的优化，所用的原始数据是从CCDC晶体数据库中提取的，构建了卟啉的分子结构，此时用高斯进行优化，探索两个卟啉分子之间的相互作用，高斯默认的是在气相的环境下计算的，晶体原始数据是通过X单晶衍射测得的，计算中是否要考虑气相和液相的问题？？ |
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zhou2009
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【答案】应助回帖
slay3(金币+6): 2011-10-25 09:56:05
slay3(金币+1): 谢谢版主，我还是个菜鸟，还有一个问题是，原卟啉即卟吩，是否含有单电子，加入了金属形成卟啉配合物后是否有呢？ 2011-10-25 10:33:14
slay3(金币+1): 谢谢版主，我还是个菜鸟，还有一个问题是，原卟啉即卟吩，是否含有单电子，加入了金属形成卟啉配合物后是否有呢？ 2011-10-25 10:33:14
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探索两个卟啉分子之间的相互作用，当你从CCDC晶体数据库中直接提取两个卟啉分子时，构建的二体卟啉的分子结构，进行高斯优化计算时，就自动是在气相的环境下计算的。 晶体数据库中提取的两个卟啉分子坐标优化之后，是气相结果，与晶体会有变化。 由于是两个卟啉分子之间的相互作用，在方法上要考虑电子相关，如b97d。 [ Last edited by zhou2009 on 2011-10-24 at 17:40 ] |
2楼2011-10-24 17:39:02
zhou2009
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5楼2011-10-25 12:58:04