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PBHU

木虫 (小有名气)

[求助] qst3找过渡态和设想结果一样但是没有虚频

qst3找到了过渡态没虚频不知道哪里有问题,请高手指点~
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-10-24 19:38:10
PBHU(金币+10): 谢谢~ 2011-10-25 07:32:36
楼主,看了你的附件,我觉得,你的输入文件有点问题,也就是说在你用qst3方法的时候,构型没有给到位,所以Gauss跑出的结果是没有虚频,建议你把该调的键长再加大点,先做Opt,再做一个IRC分析。
Terse
2楼2011-10-24 14:09:56
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PBHU

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-24 14:09:56:
楼主,看了你的附件,我觉得,你的输入文件有点问题,也就是说在你用qst3方法的时候,构型没有给到位,所以Gauss跑出的结果是没有虚频,建议你把该调的键长再加大点,先做Opt,再做一个IRC分析。

构型没给到位是什么意思?该调的键长指的是哪些键?我是个新手,麻烦具体说一下
3楼2011-10-24 14:39:00
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-24 14:39:00:
构型没给到位是什么意思?该调的键长指的是哪些键?我是个新手,麻烦具体说一下

楼主,这就需要你提供输入文件gjf,我只看到你的log文件,不知道你是要找什么过渡态......不好意思啦
Terse
4楼2011-10-24 18:50:09
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PBHU

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-24 18:50:09:
楼主,这就需要你提供输入文件gjf,我只看到你的log文件,不知道你是要找什么过渡态......不好意思啦

上传的com文件就是输入文件啊,打不开吗,再给你个gjf格式的,麻烦你帮我看看,谢谢啦~
5楼2011-10-25 07:29:42
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 07:29:42:
上传的com文件就是输入文件啊,打不开吗,再给你个gjf格式的,麻烦你帮我看看,谢谢啦~

楼主,我看了,你要做的应该是苯上氢的取代反应吧?但是,有一点你得知道,一个过渡态对应的是一个基元反应,而这个取代反应是多步反应,有多个过渡态。还有,你的丁烯炔进攻的位置和进攻原子有问题,照这个机理的话,一般来讲,应该是丁烯炔上的炔C为进攻原子,而不是H,而且还不是完全从苯环平面上进攻苯环,要与苯环平面有一个角度,同时,进攻C与苯环上被进攻C的键长得把握好,一般Gauss认为C-C断键,键长要大于1.65左右,但不要太大,要不然过渡态跑不出来。最后,我想问一句,你设置的这个机理是苯上氢先离去?然后丁烯炔再进攻?个人浅见,望对楼主有点帮助。

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Terse
6楼2011-10-25 07:57:18
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PBHU

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-25 07:57:18:
楼主,我看了,你要做的应该是苯上氢的取代反应吧?但是,有一点你得知道,一个过渡态对应的是一个基元反应,而这个取代反应是多步反应,有多个过渡态。还有,你的丁烯炔进攻的位置和进攻原子有问题,照这个机理 ...

是脱氢后的苯基与丁炔的反应,我的目的是算这个反应的反应速率,请问有何高见?


7楼2011-10-25 08:30:46
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 08:30:46:
是脱氢后的苯基与丁炔的反应,我的目的是算这个反应的反应速率,请问有何高见?

原来是这样啊,那推荐你一本书,在第九章,会告诉你怎么计算
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3716640&fpage=2
Terse
8楼2011-10-25 08:40:19
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PBHU

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-25 08:40:19:
原来是这样啊,那推荐你一本书,在第九章,会告诉你怎么计算
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3716640&fpage=2

谢谢~非常感谢
9楼2011-10-25 08:49:26
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 08:49:26:
谢谢~非常感谢

不用,倒是我不好意思,没能帮上啥
Terse
10楼2011-10-25 09:29:42
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