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PBHU

木虫 (小有名气)

[求助] qst3找过渡态和设想结果一样但是没有虚频

qst3找到了过渡态没虚频不知道哪里有问题，请高手指点~
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1楼 2011-10-24 13:54:07
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-10-24 19:38:10
PBHU(金币+10): 谢谢~ 2011-10-25 07:32:36
楼主，看了你的附件，我觉得，你的输入文件有点问题，也就是说在你用qst3方法的时候，构型没有给到位，所以Gauss跑出的结果是没有虚频，建议你把该调的键长再加大点，先做Opt，再做一个IRC分析。
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Terse
2楼2011-10-24 14:09:56
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PBHU

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-24 14:09:56:
楼主，看了你的附件，我觉得，你的输入文件有点问题，也就是说在你用qst3方法的时候，构型没有给到位，所以Gauss跑出的结果是没有虚频，建议你把该调的键长再加大点，先做Opt，再做一个IRC分析。

构型没给到位是什么意思？该调的键长指的是哪些键？我是个新手，麻烦具体说一下
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3楼2011-10-24 14:39:00
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-24 14:39:00:
构型没给到位是什么意思？该调的键长指的是哪些键？我是个新手，麻烦具体说一下

楼主，这就需要你提供输入文件gjf，我只看到你的log文件，不知道你是要找什么过渡态......不好意思啦
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Terse
4楼2011-10-24 18:50:09
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PBHU

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-24 18:50:09:
楼主，这就需要你提供输入文件gjf，我只看到你的log文件，不知道你是要找什么过渡态......不好意思啦

上传的com文件就是输入文件啊，打不开吗，再给你个gjf格式的，麻烦你帮我看看，谢谢啦~
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5楼2011-10-25 07:29:42
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 07:29:42:
上传的com文件就是输入文件啊，打不开吗，再给你个gjf格式的，麻烦你帮我看看，谢谢啦~

楼主，我看了，你要做的应该是苯上氢的取代反应吧？但是，有一点你得知道，一个过渡态对应的是一个基元反应，而这个取代反应是多步反应，有多个过渡态。还有，你的丁烯炔进攻的位置和进攻原子有问题，照这个机理的话，一般来讲，应该是丁烯炔上的炔C为进攻原子，而不是H，而且还不是完全从苯环平面上进攻苯环，要与苯环平面有一个角度，同时，进攻C与苯环上被进攻C的键长得把握好，一般Gauss认为C-C断键，键长要大于1.65左右，但不要太大，要不然过渡态跑不出来。最后，我想问一句，你设置的这个机理是苯上氢先离去？然后丁烯炔再进攻？个人浅见，望对楼主有点帮助。
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PBHU
Terse
6楼2011-10-25 07:57:18
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PBHU

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-25 07:57:18:
楼主，我看了，你要做的应该是苯上氢的取代反应吧？但是，有一点你得知道，一个过渡态对应的是一个基元反应，而这个取代反应是多步反应，有多个过渡态。还有，你的丁烯炔进攻的位置和进攻原子有问题，照这个机理 ...

是脱氢后的苯基与丁炔的反应，我的目的是算这个反应的反应速率，请问有何高见？
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7楼2011-10-25 08:30:46
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 08:30:46:
是脱氢后的苯基与丁炔的反应，我的目的是算这个反应的反应速率，请问有何高见？

原来是这样啊，那推荐你一本书，在第九章，会告诉你怎么计算
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3716640&fpage=2
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Terse
8楼2011-10-25 08:40:19
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PBHU

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-25 08:40:19:
原来是这样啊，那推荐你一本书，在第九章，会告诉你怎么计算
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3716640&fpage=2

谢谢~非常感谢
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9楼2011-10-25 08:49:26
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by PBHU at 2011-10-25 08:49:26:
谢谢~非常感谢

不用，倒是我不好意思，没能帮上啥
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Terse
10楼2011-10-25 09:29:42
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