| 查看: 401 | 回复: 2 | |||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | |||
wolveshunter至尊木虫 (著名写手)
|
[求助]
求DS2.5里PBSA的CHARMmpbsa.xml文件
|
||
|
RT~~ 谁有这个文件，上网也搜不到~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有7人回复
-
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有20人回复
-
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？
已经有19人回复
-
请教限项目规定
已经有3人回复
-
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？
已经有10人回复
-
基金申报
已经有6人回复
-
推荐一本书
已经有13人回复
-
疑惑？
已经有5人回复
-
计算机、0854电子信息（085401-058412）调剂
已经有5人回复
-
溴的反应液脱色
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 小白求助-cif文件要求txt格式
已经有7人回复
- 求助下载豆丁网或道客网文件
已经有5人回复
- 574签证 公证文件求助
已经有4人回复
- 请教该cif文件怎么拟合？
已经有5人回复
- 求助 百度文库中的pdf文件一个，有链接
已经有1人回复
- （紧急求助）我的系统重装后，txt文件都变成了乱码，怎么办？
已经有13人回复
- 【求助】如何让一个程序文件不能被复制
已经有4人回复
- 求助如何在DS2.5中分析Standard Dynamics Cascade结果！
已经有5人回复
- 【XRD求助】同样的PDF卡，不同文件里显示的出峰位置不一样
已经有3人回复
- AVI的视频文件，不能渲染，急求解决办法，谢谢
已经有2人回复
- 【求助】求助---高分子合成材料学 （下册）PDF文件
已经有4人回复
- 【求助】log文件和fchk文件不一致
已经有4人回复
- 【求助】只是优化后文件，没有restart文件，能继续跑吗
已经有22人回复
qixingbao07
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 4
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4025.6
- 红花: 6
- 帖子: 595
- 在线: 164.1小时
- 虫号: 551931
- 注册: 2008-04-28
- 专业: 药物设计与药物信息
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-23 10:25:10
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-23 10:25:10
|
转载 解决DS中加载CHARMmMMPBSA.xml的问题 版本为2.5才行 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 1.用记事本打开CHARMmMMPBSA.xml 2.查找 "" 3.第一个匹配的 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA吗？先将受体单独保存为pdb文件，将配体单独保存为mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分别选中这两个文件，点Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 |
2楼2011-10-22 06:19:09
qixingbao07
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 4
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4025.6
- 红花: 6
- 帖子: 595
- 在线: 164.1小时
- 虫号: 551931
- 注册: 2008-04-28
- 专业: 药物设计与药物信息
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wolveshunter(金币+20): 谢谢，虽然写的有点乱，好歹我还是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金币+10): 谢谢 2011-10-23 14:51:49
wolveshunter(金币+20): 谢谢，虽然写的有点乱，好歹我还是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金币+10): 谢谢 2011-10-23 14:51:49
|
第一次不全 解决DS中加载CHARMmMMPBSA.xml的问题 版本为2.5才行 以前给大家提供了一个通过PP来将MM-PBSA导入到DS中的方法，现在发现了一个更为简便的方法，不需要再安装PP了。 1.用记事本打开 Binding Energy with MM-PBSA.xml 2.查找 "The user who registered this component" 3.第一个匹配的 4.修改它下一行 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA吗？先将受体单独保存为pdb文件，将配体单独保存为mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分别选中这两个文件，点Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 |
3楼2011-10-22 06:21:31