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wolveshunter至尊木虫 (著名写手)
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[求助]
求DS2.5里PBSA的CHARMmpbsa.xml文件
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RT~~ 谁有这个文件，上网也搜不到~~ |
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qixingbao07
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【答案】应助回帖
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御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-23 10:25:10
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-23 10:25:10
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转载 解决DS中加载CHARMmMMPBSA.xml的问题 版本为2.5才行 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 1.用记事本打开CHARMmMMPBSA.xml 2.查找 "" 3.第一个匹配的 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA吗？先将受体单独保存为pdb文件，将配体单独保存为mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分别选中这两个文件，点Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 |
2楼2011-10-22 06:19:09
qixingbao07
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wolveshunter(金币+20): 谢谢，虽然写的有点乱，好歹我还是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金币+10): 谢谢 2011-10-23 14:51:49
wolveshunter(金币+20): 谢谢，虽然写的有点乱，好歹我还是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金币+10): 谢谢 2011-10-23 14:51:49
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第一次不全 解决DS中加载CHARMmMMPBSA.xml的问题 版本为2.5才行 以前给大家提供了一个通过PP来将MM-PBSA导入到DS中的方法，现在发现了一个更为简便的方法，不需要再安装PP了。 1.用记事本打开 Binding Energy with MM-PBSA.xml 2.查找 "The user who registered this component" 3.第一个匹配的 4.修改它下一行 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA吗？先将受体单独保存为pdb文件，将配体单独保存为mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分别选中这两个文件，点Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目录下的pbsa应该就可以找到，原来的文件名应该是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是这样 应该清楚了吧 |
3楼2011-10-22 06:21:31