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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefﬁcients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent ﬁeld procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of ﬁrst-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]

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嘟啦啦嘟啦啦嘟

1楼2011-10-17 11:00:34

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zhou2009

版主 (著名写手)

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专业: 理论和计算化学
管辖: 量子化学

【答案】应助回帖

为什么只是算两个分子HOMO之间的呢？而且还只是overlap integral呢？

两个分子之间的作用并不是二者HOMO之间的作用，把两个分子放在一起算，之间的作用就都有了。
当然如何放分子，可以观察A的HOMO与B的LUMO，或者A的LUMO与B的HOMO，看二者如何搭配、放置作为初始优化的起点比较好。优化的结果就得到了两个分子之间的作用了。

两个分子之间的overlap integral，只是轨道（用基组表达的）之间的，说明不了问题。要考察的是重叠布居。
将AB的计结果在Multiwfn中求全AB的电子密度ρAB，并在Multiwfn中进一步分别求分子片A、分子片B的电子密度ρa、ρB。求电子密度差Δρ=ρAB-ρa-ρB。
这时Δρ就是分子片A、分子片B之间的重叠布居。

[ Last edited by zhou2009 on 2011-10-17 at 19:30 ]