24小时热门版块排行榜    

查看: 2509  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

daidai~

铁虫 (小有名气)

[求助] vasp并行出错,急于求助!!!

我在进行vasp的ENCUT值验证时,调用了一个并行的脚本,但是我对脚本是一无所知,运行后几秒就出现了以下的报错信息,麻烦各位帮忙看看问题是在什么地方?
running /opt/vasp/bin/vasp52-intel.mpich on 16 LINUX ch_p4 processors
Created /home/liaoy271/vasp/ENCUT/ENCUT-PBE/PI14610
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.


运行的脚本内容如下:
#!/bin/sh -f
#PBS -N test
#PBS -l nodes=1:ppn=4
#PBS -o stdout.inf
#PBS -e stderr.inf
#PBS -j oe
#PBS -q workq

EXEC=/opt/vasp/bin/vasp52-intel.mpich
MPI_HOME=/opt/mpich

NCPU=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
echo ">>StartRunning " `date`
cd ${PBS_O_WORKDIR}
echo Runing on host `hostname`
echo Starting Time is `date`
echo Directory is `pwd`
echo This jobs runs on the following processors:
echo `cat $PBS_NODEFILE`
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
echo This job has allocated $NPROCS nodes

## 512 MB
export P4_GLOBMEMSIZE=536870912

######### User Parallel Program ###########

$MPI_HOME/bin/mpirun -v -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS $EXEC > out

###########################################

echo ">>StopRunning  " `date`







请大家帮忙看看是不是脚本的问题??谢谢谢谢,着急找原因的小虫~~~·
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

这个不是INCAR,这是交作业的脚本
6楼2011-09-24 16:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

daidai~

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-24 16:07:34:
你做的NEB计算?

NEB 计算是指什么计算?我只是听说过,不知道具体指的是什么。
我是在算一种物质的能带,就是用vasp进行能带计算的,计算之前要进行参数的验证,现在出错的步骤就是在验证ENCUT值时出现的,麻烦您帮我看看是怎么回事呀?
3楼2011-09-24 16:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖


daidai~(金币+2): 2011-09-24 16:35:53
daidai~(金币+2): 2011-09-24 16:55:28
youzhizhe(金币+1): 谢谢参与。 2011-09-29 13:34:38
您可以把INCAR的内容贴上来让大家一起分析
4楼2011-09-24 16:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daidai~

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-24 16:07:34:
你做的NEB计算?

还想麻烦您帮我看看下面的这个脚本和问题中用的那个脚本有什么区别,我觉得好像都是vasp并行计算时用到的脚本,但是还不清楚分别是什么情况下使用的:
#!/bin/sh -f
#PBS -N Q8-opt
#PBS -l nodes=2:ppn=8
#PBS -o stdout.inf
#PBS -e stderr.inf
#PBS -q workq

NCPU=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
echo ">>StartRunning " `date`
cd ${PBS_O_WORKDIR}
echo Runing on host `hostname`
echo Starting Time is `date`
echo Directory is `pwd`
echo This jobs runs on the following processors:
echo `cat $PBS_NODEFILE`
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
echo This job has allocated $NPROCS nodes

mpirun -v -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/vasp/bin/vasp-intel.mpich > out

echo ">>StopRunning  " `date`
5楼2011-09-24 16:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 大佬帮着分析今年的评审意见?该课题连续申请了三年了,明年要不要换个方向。 100+3 cai-11138 2026-08-31 11/550 2026-09-06 20:49 by archvillain
[文学芳草园] 两块石头 +7 阿美_Lml888 2026-09-03 10/500 2026-09-06 20:08 by 阿美_Lml888
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:41 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:21 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:01 by eObJPa4gWmp6
[找工作] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 17:49 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 17:21 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!! +5 SCSIOyxguo 2026-09-03 8/400 2026-09-06 15:06 by 可爱小花朵
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[文学芳草园] 初秋的晨风 +4 阿美_Lml888 2026-09-04 6/300 2026-09-05 13:51 by 阿美_Lml888
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
请填处理意见