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cug_zhang金虫 (正式写手)
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[求助]
关于Gaussian计算结果出现断键与虚频处理的问题
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小弟是个Gaussian新手，正在学习中。现有几个个问题感到困惑： 举例如下：比如我画了一个6个原子的6边形结构，名字为Si6.gif，设置好Gaussian参数，其中在设置的时候Calculate->Gaussian Calculation Setup->General->Write connectivity 选中（之所以选中这一项，是我在论坛中看到选中该项则输出结果的结构不会出现断键），然后submit，启动计算，计算无误，但是有一个虚频，并且出现断键。接下来就需要处理虚频了，我在论坛看到一个处理虚频的方法，即用Gview打开out文件，然后点击菜单Results-》Vibrations-》选中虚频-》Manual displacement，数值我设置为0.2，点击Save structure，这时候就弹出一个New ，里面的图形结构和OUt文件中的一模一样，有断键，再接下来就是设置计算参数，我将该文件存盘为Si6-1.gif，启动Gaussian计算，无误，虚频没有了。 我的疑问是： （1）为什么我按照论坛中的说明“Calculate->Gaussian Calculation Setup->General->Write connectivity 选中”，结果文件还会有断键？有高手解释说断不断键不影响，只是一个显示问题。可我总觉得看着别扭，有什么其他办法可以解决断键？ （2）关于虚频，“用Gview打开out文件，然后点击菜单Results-》Vibrations-》选中虚频-》Manual displacement，数值我设置为0.2，点击Save structure，这时候就弹出一个New ”，我的问题是这个新文件的结构和我原来文件的结构是不是一样（因为有断键，我看不出来）？最后的计算结果到底是对还是错？我自己的想法是点击Save structure后应该是针对原来的结果的，不应该出现一个New呀？ 请高手帮忙讲解一下把，谢谢！ |
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fatpig8832
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