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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » SNP检测问题
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+10, MolEPI+1): 三楼一起奖励了 2011-09-13 18:09:17
先发个简单介绍

HRM技术服务之SNP检测（snp检测的最佳方案）
单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），指单个核苷酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象，这就是SNP。SNP在人类基因组中数量较多，发生频率较高，因此被认为是继微卫星之后的新一代遗传学标记。
HRM检测SNP技术是依据在一定的温度范围内将PCR扩增的产物进行变性，期间实时检测体系内荧光信号。荧光值随着温度变化，可绘制溶解曲线。每一段DNA都有其独特的序列，因而也就有了独特的熔解曲线形状，如同DNA指纹图谱一样，具有很高的特异性、稳定性和重复性。根据曲线准确区分野生型纯合子、杂合子和突变性纯合子（下图）。

检测SNP的方法有很多种。成本较低、通量较大的方法大都局限于已知、特定位点，如Taqman探针法。既要对已知位点分析又要查找未知位点，一般采用PCR+测序的方法，成本高、操作繁复较低。

优点（商家宣称）：
作为新一代的遗传扫描工具,HRM技术是一种低成本、高通量、快速，且不受位点局限的检测方法，是SNP筛查的最佳选择。其具有"简、效、快、廉"等其他技术难以比拟的优势:
      简：无需序列特异性探针,不受碱基位点局限,同时检出已知或未知突变、SNP和甲基化位点：闭管操作，避免交叉污染。
      效：最低检测0.1%-0，01%的突变或异常甲基化检测SNP灵敏度和特异性均为100%，。
      快：1次同时不多于384个样本，在60-90分钟内完成检测。
      廉：简化操作步骤、降低人工和试剂成本，费用远少于测序、Taqman探针等方法。
HRM技术特别适用于样本量多、检测位点较少的SNP、突变或甲基化分析，是不同于基因芯片检测方法（检测位点多，样本少）的高通量方法。同时，也是基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的最佳方法。




[ Last edited by wanhscn on 2011-9-13 at 18:03 ]
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-09-13 17:52:08
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