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jolly1987金虫 (小有名气)
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在DPD中如何计算获得均方末端距?
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请问在DPD中如何计算获得均方末端距?在Analysis里有看到End-to-end distribution,帮助软件说:“End-point distribution: returns a histogram of the end-to-end distance of a molecule for each of the frames selected. The histogram is accumulated over all molecules and all steps up until the previous frame. Also returned is the corresponding radial distribution, which is the histogram divided by the total bin count and the volume of each bin." 没太明白什么意思,能用来计算均方末端距吗?望高人指点~谢谢! |
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6楼2011-09-05 17:31:51
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
jolly1987(金币+1): 2011-09-05 16:52:29
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-09-05 18:00:41
jolly1987(金币+1): 2011-09-05 16:52:29
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-09-05 18:00:41
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“$\sqrt \langle R_e^2 \rangle = \int P(R_e) R_e^2 d R_e$“是求均方末端矩的公式啊 自己思考思考distribution表示什么,那你就该知道单位是什么。在分子模拟中我们一般用离散的histogram来近似连续的distribution,那么我们需要用到bins,例如Re的范围在1-10,我们可以用100个bins,第一个bin对应的Re范围就是[1,1.1]。顾名思义,bin count就是落在特定bin中的样本数目。 |
4楼2011-09-05 16:27:05
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8楼2011-09-05 22:31:07
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