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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS做虚拟筛选，所需内存
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[求助] DS做虚拟筛选，所需内存

用DS做虚拟筛选，NCI二十多万的分子，把DS安装在C盘，十几个G，C盘共有30G，可是算了三小时后，就显示内存不够，要释放空间，DS究竟要多大空间才能算完呢？
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1楼 2011-09-04 15:21:51
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-05 18:05:27
绿茶QJM(金币+2): 2011-09-09 11:24:41
（1）试试用360硬件大师，不时地强制释放内存。
（2）用SDFSpliter之类的小工具，把NCI分解成1万个分子一个文件的碎尸。
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2楼2011-09-04 18:16:34
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程》
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故地如重游月圆更寂寞
3楼2011-09-05 18:20:48
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
引用回帖:
2楼: Originally posted by yalefield at 2011-09-04 18:16:34:
（1）试试用360硬件大师，不时地强制释放内存。
（2）用SDFSpliter之类的小工具，把NCI分解成1万个分子一个文件的碎尸。

请问老汉：SDFSpliter之类的小工具  可以在什么地方可以下载？非常感谢
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
4楼2011-09-06 13:04:16
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+6): 谢谢 2011-09-13 07:37:40
http://cactus.nci.nih.gov/SDF_toolkit/NCI_db_examples.html

http://www.ccl.net/chemistry/res ... .012-dir/index.html

http://blueobelisk.shapado.com/q ... into-n-smaller-sets
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5楼2011-09-09 16:23:37
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hcw7210

金虫 (初入文坛)
★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-17 13:17:08
搞了很长时间，换了电脑，2G显卡，8G内存，i7-2670QM处理器，模拟10ps成功，时间长还是提示内存不足！最后看了看，虽然物理内存使用40%，把虚拟内存设置为自动管理，运行8个小时，发现虚拟内存已到17G了！不知什么原因，难道虚拟内存也要足够大，你可以参考！
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6楼2011-11-16 20:46:56
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870609

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2012-01-11 19:53:03
如果做大计算的话建议还是不要在windows系统中做，32位的win只支持最大4g内存，条子安得再多也没用。还是用linux做大计算比较稳定
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7楼2012-01-09 09:51:20
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