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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 构型建造求助！
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aa644387857

铜虫 (小有名气)

[求助] 构型建造求助！

请问这种构型是怎么是怎么建造的啊！使O原子正好在Ti 上方，H-O-Ti的角度相同，我弄了一周还没弄出来！！谢谢各位大师了！


[ Last edited by aa644387857 on 2011-8-31 at 08:35 ]
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努力，奋斗
1楼 2011-08-30 21:44:40
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aa644387857

铜虫 (小有名气)
没人帮帮我吗？
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努力，奋斗
2楼2011-08-31 15:22:13
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-09-15 12:14:55
主要是这个问题太不好回答了，总不能让别人把具体步骤一步步的描述出来吧？
如果是连基本的建立方法都不知道，最好参考帮助文件中分子吸附模型的教程。
如果是遇到了某个困难，则把具体的问题说清楚。
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3楼2011-08-31 15:49:14
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buct2010

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by acridine at 2011-08-31 15:49:14:
主要是这个问题太不好回答了，总不能让别人把具体步骤一步步的描述出来吧？
如果是连基本的建立方法都不知道，最好参考帮助文件中分子吸附模型的教程。
如果是遇到了某个困难，则把具体的问题说清楚。

说的对，MS自己多用用就知道怎么构建模型了，
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4楼2011-08-31 16:24:37
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aa644387857

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by acridine at 2011-08-31 15:49:14:
主要是这个问题太不好回答了，总不能让别人把具体步骤一步步的描述出来吧？
如果是连基本的建立方法都不知道，最好参考帮助文件中分子吸附模型的教程。
如果是遇到了某个困难，则把具体的问题说清楚。

我的方法是将优化好的H2O贴到模型中，然后通过旋转、平移能差不多把H2O按放到Ti上方，但是所建构型需要H2O正好在Ti上方，O的X,Y坐标与Ti相同，我通过调整原子坐标但调整不出来，请问你们做这种模型的思路是什么啊？是不是和我思路一样啊！
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努力，奋斗
5楼2011-08-31 16:55:55
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dgcrcat

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
aa644387857(金币+20): 3 2011-08-31 19:43:46
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-09-01 10:45:58
可以利用测量工具，测出distance，angle，并选中，在properties中进行调整
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6楼2011-08-31 16:57:49
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-09-01 10:46:10
引用回帖:
5楼: Originally posted by aa644387857 at 2011-08-31 16:55:55:
我的方法是将优化好的H2O贴到模型中，然后通过旋转、平移能差不多把H2O按放到Ti上方，但是所建构型需要H2O正好在Ti上方，O的X,Y坐标与Ti相同，我通过调整原子坐标但调整不出来，请问你们做这种模型的思路是什么啊 ...

你的思路没有错，通过MS中的平移、旋转功能应该能实现你所说的。我想没有必要做到十足的精确吧，因为在建立模型之后你还是要再次优化结构的。
如果对MS这种平移、旋转操不熟悉（估计你应该是这种情况，否则不会那么久还没有完成的），计算任务又很急迫，我倒是建议你可以在slab模型的基础上，利用add atom选项来一个个的添加吸附原子，好在你的模型总共才吸附3个原子而已。而这三个原子的坐标，根据图(a)，是可以手动算出来的。
至于这种平移旋转操作怎么学习，如果有条件的话找个熟悉MS的人给你示范一下是最好的，因为单纯语言描述起来确实枯燥且难以理解。可以查看帮助文件中的 模型建立、鼠标操作 等关键词，应该多少会有写启发吧。
bless
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7楼2011-08-31 18:05:27
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guolianshun

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-09-14 17:55:38
这个在教程有上有类似的吸附，其实本人感觉可以按照5楼观点，毕竟还要优化呀，这个可以试试，算算结果。
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8楼2011-09-14 16:41:32
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amition

木虫 (正式写手)
我也觉得可以直接在Ti直接添加一个O，然后根据优化好的H2O分子 参数 在O上分别添加2个H~~先添加一个H调整角度和距离  然后再添加另一个。。
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9楼2011-09-14 19:50:46
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aa644387857

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by amition at 2011-09-14 19:50:46:
我也觉得可以直接在Ti直接添加一个O，然后根据优化好的H2O分子 参数 在O上分别添加2个H~~先添加一个H调整角度和距离  然后再添加另一个。。

那好像也要算出H的分子坐标吧，这样的话，如果吸附复杂分子会很麻烦啊！
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努力，奋斗
10楼2011-09-15 08:21:27
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